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原文传递 数字病理切片分析方法和装置
专利名称: 数字病理切片分析方法和装置
摘要: 本发明公开了一种数字病理切片分析方法和装置。其中,该方法包括:获取待分析病理切片的数字图像,其中,数字图像是对病理切片进行染色处理并数字化的图像;基于预先训练的数字病理切片分析模型,对待分析病理切片的数字图像进行分析,得到待分析病理切片的分析结果,其中,数字病理切片分析模型的输入数据为病理切片的数字图像,数字病理切片分析模型的输出数据为病理切片的分析结果。本发明可以实现采用人工智能对病理切片染色处理后的数字图像进行分析,提高切片分析工作效率和准确性的技术效果。
专利类型: 发明专利
国家地区组织代码: 浙江;33
申请人: 杭州迪英加科技有限公司
发明人: 崔磊;王春宝;韩鑫;亢宇鑫;惠文丽;杨林
专利状态: 有效
申请日期: 2019-05-09T00:00:00+0800
发布日期: 2019-09-10T00:00:00+0800
申请号: CN201910385581.8
公开号: CN110220902A
代理机构: 杭州华知专利事务所(普通合伙)
代理人: 张德宝
分类号: G01N21/84(2006.01);G;G01;G01N;G01N21
申请人地址: 311121 浙江省杭州市余杭区仓前街道龙潭路7号杭州未来研创园B座5楼B501-B508室
主权项: 1.一种数字病理切片分析方法,其特征在于,包括: 获取待分析病理切片的数字图像,其中,所述数字图像是对病理切片进行染色处理并数字化的图像; 基于预先训练的数字病理切片分析模型,对所述待分析病理切片的数字图像进行分析,得到所述待分析病理切片的分析结果,其中,所述数字病理切片分析模型的输入数据为病理切片的数字图像,所述数字病理切片分析模型的输出数据为病理切片的分析结果。 2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于预先训练的数字病理切片分析模型,对所述待分析病理切片的数字图像进行分析,得到所述待分析病理切片的分析结果,包括: 对所述待分析病理切片的数字图像进行子区域化处理,得到多个子区域图像; 将所述各个子区域图像分别输入到所述数字病理切片分析模型,得到各个包含各个子区域图像分析结果的数字图像; 对所述多个子区域图像的分析结果进行集成化处理,得到包含所述待分析病理切片整体分析结果的数字图像。 3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,对所述待分析病理切片的数字图像进行子区域化处理,得到多个子区域图像,包括: 获取病理切片对应的kfb格式数字图像和json文件,其中,病理切片对应的json文件中包含病理切片上至少一个标注区域在所述kfb格式数字图像上的坐标信息; 根据所述kfb格式数字图像的尺寸信息和滑动窗口的尺寸信息,计算所述滑动窗口在所述kfb格式数字图像上每一行和每一列滑动的步数; 将所述滑动窗口按照所述每一行和每一列滑动的步数,在所述kfb格式数字图像上滑动,得到多个没有重叠区域的栅格,获取每个栅格在所述kfb格式数字图像上的坐标信息; 根据每个栅格在所述kfb格式数字图像上的坐标信息提取每个栅格在所述kfb格式数字图像上所覆盖区域对应的图像,保存为png格式栅格图像,并记录每个栅格图像在所述kfb格式数字图像上的行号、列号和序号; 根据每个标注区域在所述kfb格式数字图像上的坐标信息和每个栅格在所述kfb格式数字图像上的坐标信息,将病理切片上各个标注区域的坐标信息保存到相应的栅格图像的json文件中。 4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,根据每个标注区域在所述kfb格式数字图像上的坐标信息和每个栅格在所述kfb格式数字图像上的坐标信息,将病理切片上各个标注区域的坐标信息保存到相应的栅格图像的json文件中,包括: 如果某个标注区域完全包含于某个栅格内,则将该标注区域的坐标信息保存到该栅格对应的栅格图像的json文件中; 如果某个标注区域未完全包含于某个栅格内,但与该栅格存在交叉区域,则提取该交叉区域的坐标信息保存到该栅格对应的栅格图像的json文件中。 5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,对所述多个子区域图像的分析结果进行集成化处理,得到包含所述待分析病理切片整体分析结果的数字图像,包括: 根据栅格图像的最大行号和最大列号创建一个空图像; 根据栅格图像的序号,对根据所述kfb格式数字图像子区域化的多个栅格图像进行排序,并按照顺序依次覆盖于所述空图像上,得到包含所述待分析病理切片整体分析结果的数字图像。 6.根据权利要求1至5任一所述的方法,其特征在于,所述数字图像为病理切片的D2-40免疫组化染色数字图像,所述数字病理切片分析模型为淋巴管侵润检测模型。 7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述淋巴管侵润检测模型为基于深度学习的Faster-RCNN检测模型。 8.一种数字病理切片分析装置,其特征在于,包括: 切片数字图像获取模块,用于获取待分析病理切片的数字图像,其中,所述数字图像是对病理切片进行染色处理并数字化的图像; 切片分析模块,用于基于预先训练的数字病理切片分析模型,对所述待分析病理切片的数字图像进行分析,得到所述待分析病理切片的分析结果,其中,所述数字病理切片分析模型的输入数据为病理切片的数字图像,所述数字病理切片分析模型的输出数据为病理切片的分析结果。 9.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至7任一所述的数字病理切片分析方法。 10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有执行权利要求1至7任一所述数字病理切片分析方法的计算机程序。
所属类别: 发明专利
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