详情

原文传递诊断法

专利名称：	诊断法
摘要：	一种诊断或监测鸟分枝杆菌副结核亚种(MAP)感染的方法，所述方法包括检测来自受试者的样本中的由IS900的正链所编码的多肽(MAP P900)或其片段的存在，其中使用与MAP P900结合的抗体或其抗原结合片段来检测MAP P900或其片段。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	英国;GB
申请人：	HAV疫苗有限公司
发明人：	约翰·赫尔蒙-泰勒
专利状态：	有效
申请日期：	2018-01-11T00:00:00+0800
发布日期：	2019-11-19T00:00:00+0800
申请号：	CN201880017768.6
公开号：	CN110476065A
代理机构：	广州华进联合专利商标代理有限公司
代理人：	刘培培;黄爱娇
分类号：	G01N33/569(2006.01);G;G01;G01N;G01N33
申请人地址：	英国伦敦
主权项：	1.一种诊断或监测鸟分枝杆菌副结核亚种(MAP)感染的方法，所述方法包括检测来自受试者的样本中的由IS900的正链所编码的多肽(MAP P900)或其片段的存在，其中使用与MAP P900结合的抗体或其抗原结合片段来检测MAP P900或其片段。 2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述抗体或其抗原结合片段与由SEQ IDNO：1的第24至71位或第329至386位氨基酸所限定的MAP P900区域结合。 3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述抗体或其抗原结合片段与由以下所限定的MAP P900区域结合： -SEQ ID NO：1的第26至71位氨基酸； -SEQ ID NO：1的第329至385位氨基酸； -SEQ ID NO：1的第26至39位氨基酸； -SEQ ID NO：1的第52至68位氨基酸； -SEQ ID NO：1的第345至359位或第350至359位氨基酸； -SEQ ID NO：1的第26至71位氨基酸，其中第37位丝氨酸被磷酸化； -SEQ ID NO：1的第345至359位或第350至359位氨基酸，其中第357位丝氨酸被磷酸化和/或第358位丝氨酸被磷酸化； 4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于，使用所述抗体或其抗原结合片段中的两种或更多种来检测MAP P900。 5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述方法使用： -与由SEQ ID NO：1的第26至71位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少一种抗体和与由SEQ ID NO：1的第329至385位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少另一种抗体； -与由SEQ ID NO：1的第26至39位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少一种抗体和与由SEQ ID NO：1的第52至68位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少另一种抗体； -与由SEQ ID NO：1的第52至68位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少一种抗体和与由SEQ ID NO：1的第345至359位或第350至359位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少另一种抗体； -与由SEQ ID NO：1的第26至71位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少一种抗体，其中第37位丝氨酸任选地被磷酸化；和与由SEQ ID NO：1的第345至359位或第350至359位氨基酸所限定的所述MAP P900区域结合的至少另一种抗体，其中第357位丝氨酸和/或第358位丝氨酸任选地被磷酸化。 6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述方法包括确定在SEQ ID NO：1的第273至406位氨基酸之间的MAP P900区域或其任一片段是否已从与膜结合的MAP P900上切割下来。 7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述方法包括确定切割的MAP P900区域或其片段是否已从含有与膜结合的MAP P900的微生物细胞和/或宿主细胞中扩散。 8.根据权利要求2至6中任一项所述的方法，其特征在于，与由第24至71位氨基酸所限定的MAP P900区域结合的抗体与氨基酸序列MVINDDAQRLLSQR、AAVTTLADGGEVTWAID或MVINDDAQRLL[pS]QR结合和/或与由SEQ ID NO：1的第329至386位氨基酸所限定的MAP P900区域结合的抗体与氨基酸序列YLSALVSIRTDPSSR或NLKRPRRYDRRLLRA结合或与一个或多个丝氨酸残基被磷酸化的氨基酸序列YLSALVSIRTDPSSR结合。 9.根据权利要求4至8中任一项所述的方法，其特征在于，所述方法使用与非磷酸化MAPP900序列特异性结合的至少一种抗体和与磷酸化MAP P900序列特异性结合的至少另一种抗体。 10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，所述非磷酸化MAP P900序列是MVINDDAQRLLSQR，并且所述磷酸化MAP P900序列是MVINDDAQRLL[pS]QR，或所述非磷酸化MAP P900序列是YLSALVSIRTDPSSR或VSIRTDPSSR，并且所述磷酸化MAP P900序列是YLSALVSIRTDPS[pS]R、YLSALVSIRTDP[pS]SR、VSIRTDP[pS][pS]R、VSIRTDP[pS]SR或VSIRTDP[pS][pS]R。 11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述样本是体液的样本或组织样本。 12.根据权利要求11所述的方法，其特征在于，所述体液是血液、精液、羊水、脑脊髓液、滑液或母乳，或所述组织是皮肤样本、胃肠道、甲状腺、淋巴结、脑或泌尿生殖道。 13.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者患有克罗恩病、银屑病、甲状腺炎、帕金森病、1型糖尿病、关节炎、强直性脊柱炎、肠易激综合征、溃疡性结肠炎、炎性肠病、阿尔茨海默病、多发性硬化症、结节病、特发性肺纤维化和/或慢性疲劳综合征。 14.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其特征在于，所述受试者是动物。 15.一种抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段与由SEQ ID NO：1的第26至71位氨基酸所限定的MAP P900区域特异性结合。 16.根据权利要求15所述的抗体或其抗原结合片段，其特征在于，所述抗体与氨基酸序列MVINDDAQRLLSQR、AAVTTLADGGEVTWAID或MVINDDAQRLL[pS]QR结合。 17.一种抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段与由SEQ ID NO：1的第26至71位或第345至371位氨基酸所限定的MAP P900区域内的磷酸化序列特异性结合。 18.根据权利要求17所述的抗体或其抗原结合片段，其特征在于，当一个或多个丝氨酸残基被磷酸化时，所述抗体与序列MVINDDAQRLLSQR或YLSALVSIRTDPSSR结合。 19.一种抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段与由SEQ ID NO：1的第329至360位氨基酸所限定的MAP P900区域内的氨基酸序列YLSALVSIRTDPSSR或NLKRPRRYDRRLLRA或其任一种的磷酸化形式特异性结合。 20.根据权利要求15至19中任一项所述的抗体，其特征在于，所述抗体是单克隆抗体、嵌合抗体、重组抗体、合成抗体或单域抗体。 21.根据权利要求15至20中任一项所述的抗体，其特征在于，所述抗体是标记的抗体。 22.根据前述权利要求中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段在诊断或监测MAP感染的离体方法中的用途。 23.根据前述权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段在监测MAP感染的治疗，或患有克罗恩病、溃疡性结肠炎、银屑病、甲状腺炎、结节病、帕金森病、多发性硬化症、1型糖尿病、关节炎、强直性脊柱炎以及肠易激综合征、炎性肠病、阿尔茨海默病、多发性硬化症、特发性肺纤维化和/或慢性疲劳综合征的受试者的治疗的离体方法中的用途。 24.根据权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段用于检测食品中的MAP的用途。 25.根据权利要求24所述的用途，其特征在于，所述食品是乳汁或其他乳制品或肉制品。 26.根据权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段在用于检测环境样本中的MAP的方法中的用途。 27.根据权利要求26所述的用途，其特征在于，所述环境样本是地表水、河水、水处理厂的水、生活用水的样本、或气溶胶、土壤或沉积物。 28.根据权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段用于捕获用于质谱(MS)表征的肽的用途。 29.一种MAP P900的肽片段，所述肽片段具有多达40个氨基酸，所述肽片段包含以下序列中的一个或多个：MVINDDAQRLLSQR、VTTLADGGEVTWAID、NLKRPRRYDRRLLRA、VSIRTDPSSR以及YLSALVSIRTDPSSR，其中所述肽任选地被磷酸化。 30.根据权利要求29所述的肽，其特征在于，所述肽由MAP P900氨基酸序列的多达25个氨基酸的组成。 31.根据权利要求29或30所述的肽，其特征在于，所述肽被磷酸化并包含以下序列之一：MVINDDAQRLL[pS]QR或YLSALVSIRTDPS[pS]R、YLSALVSIRTDP[pS]SR或YLSALVSIRTDP[pS][pS]R。 32.根据权利要求29至31中任一项所述的肽，其特征在于，所述肽在N-末端和/或在C-末端经修饰和/或与载体分子缀合或偶联。 33.一种产生与MAP P900特异性结合的抗体的方法，所述方法包括将根据权利要求29至31中任一项所述的肽给药至实验动物以产生免疫响应并从所述动物中分离抗体。 34.根据权利要求33所述的方法，其特征在于，还包括通过确定所述抗体是否与根据权利要求29至31中任一项所述的肽结合以及所述抗体是否与来自相关生物体的同源肽结合来筛选与MAP P900特异性结合的所述分离的抗体，其中当肽与根据权利要求29至31中任一项所述的肽结合但不与来自相关生物体的同源肽结合时，所述肽对MAP P900具有特异性。 35.一种根据权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段用于在人体或动物体上进行的治疗或诊断方法。 36.一种根据权利要求1至21中任一项所定义的抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段用于治疗或预防MAP感染的方法中。
所属类别：	发明专利