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原文传递 一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法及其应用
专利名称: 一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法及其应用
摘要: 本发明涉及的一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法,收集正常人和干眼病患者眼泪样本;对样本进行UHPLC‑Q‑TOF‑MS检测,得到原始代谢指纹图谱,对测到的代谢物进行鉴定,得到正常人和干眼病患者眼泪样本的代谢物数据,将正常人和干眼病患者眼泪样本的代谢物数据,通过中位数归一化法进行数据标准化后,借助有监督模式识别的偏最小二乘判别分析法结合T检验法筛选出差异的代谢物。本发明的有益效果在于:本发明干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法是通过收集正常人和干眼病患者眼泪样本,反映正常人和干眼病患者眼泪样本的眼泪中的代谢物变化情况,能够对判断干眼病是否治疗提供有效的参考。
专利类型: 发明专利
申请人: 江西省肿瘤医院(江西省癌症中心)
发明人: 饶军;钭方芳;郑智;吴鲁华;娄尚
专利状态: 有效
申请日期: 1900-01-20T00:00:00+0805
发布日期: 1900-01-20T21:00:00+0805
申请号: CN201911347846.1
公开号: CN111044630A
代理机构: 宿迁市永泰睿博知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人: 刘慧
分类号: G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/36;G01N30/72;G01N30/86;G;G01;G01N;G01N30;G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/36;G01N30/72;G01N30/86
申请人地址: 330000 江西省南昌市北京东路519号
主权项: 1.一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、收集正常人和干眼病患者眼泪样本,作为分析样本; S2、将每个分析样本采用UHPLC-Q-TOF-MS代谢组学技术进行分析,得到正常人和干眼病患者眼泪样本的原始代谢指纹图谱; S3、将正常人和干眼病患者眼泪样本眼泪样本的原始代谢指纹图谱与PersonalCompoundDatabase and Library(PCD/PCDL)数据库、Massbank数据库和人眼泪代谢组学参考文献中的二级质谱数据相比较,对测到的代谢物进行鉴定,得到正常人和干眼病患者眼泪样本代谢物数据; S4、将正常人和干眼病患者眼泪样本的代谢物数据,通过中位数归一化法进行数据标准化后,借助有监督模式识别的偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)结合T检验法筛选出差异的代谢物; S5、将差异代物通过MetaboAnalyst在线软件进行“Pathway analysis”分析,选择“Hypergeometric Test”算法和“Home sapients”数据库,根据p<0.05确定显著变化的代谢途径; 色谱柱为Agilent Eclipse-plus C18柱,规格为150×3.0mm,1.8μm,进样量为3.00μl,柱温为40摄氏度;流动相A为0.1%甲酸水溶液,B为100%乙腈;流动相的洗脱梯度如下:0min,98.0%A;1.0min,98%A;5.0min,60%A;12.0min,30%A;15.0min,5%A;20.0min,5%A。流动相的流速为0.40ml/min; 质谱检测使用Agilent 6550iFunnel/Q-TOF质谱检测器,全扫描模式记录质荷比50-1000之间的离子的数据,扫描速度为2张谱图/秒;电喷雾离子源使用正极和负极两种离子化模式,毛细管电压为3.5kV,喷嘴电压正极时为250V、负极时为1500V,碰撞电压为380V,喷雾器压强为25psi,鞘气和干气的流速分别为12L/min和16L/min,电荷注入检测器电压分别使用5V、10V、15V、20V、25V、30V、35V和40V。 2.根据权利要求1所述的干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法,其特征在于,所述正常人和干眼病患者眼泪样本均来自18-87岁人群。 3.根据权利要求1所述的干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法,其特征在于:所述正常人眼泪样本为18个,干眼病患者眼泪样本为19个。 4.根据权利要求1所述的干眼病用眼泪代谢组学分析模型的构建方法,其特征在于:所述图谱预处理方法包括对于多天研究时仪器日间调整的差异进行校正;在确保每天特定代谢物的中位数相同的条件下,各个样品中每个代谢物特征峰的数目需要除以其中位数进行标准化;数据标准化后,将缺失值使用最小值替代。 5.一种干眼病用眼泪代谢组学分析代谢途径变化的方法在判断干眼病治疗效果中的应用。
所属类别: 发明专利
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