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原文传递 一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸
专利名称: 一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸
摘要: 本发明公开了一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,所述检测试纸的试纸条包括背衬层,在背衬层上,从一端到另一端依次部分重叠设置样品垫、结合垫、色谱膜和吸收垫,所述检测试纸基于配体酶对样品进行识别,优选地采用胶体金层析,通过基于二级结构预测的计算机辅助设计对配体酶的两端设计RNA接头探针,胶体金和色谱膜上的生物素均偶联能够分别与配体酶两端的RNA接头探针互补的寡核苷酸序列,以此实现样品的侧流层析检测,本发明的层析检测试纸条高效快捷,可以简化筛选流程,减少探针反复优化设计的次数,降低产品差异性,提高试纸平台的通用性,并相对于现有方案提高检测灵敏度。
专利类型: 发明专利
国家地区组织代码: 上海;31
申请人: 上海交通大学
发明人: 马钢;朱子健;胡鼎康;王毓舒
专利状态: 有效
申请日期: 2022-10-20T00:00:00+0800
发布日期: 2023-01-03T00:00:00+0800
申请号: CN202211288249.8
公开号: CN115561451A
代理机构: 上海旭诚知识产权代理有限公司
代理人: 郑立
分类号: G01N33/543;G01N33/558;C12N15/11;C12N15/52;G16B15/30;G16B25/20;G;C;G01;C12;G16;G01N;C12N;G16B;G01N33;C12N15;G16B15;G16B25;G01N33/543;G01N33/558;C12N15/11;C12N15/52;G16B15/30;G16B25/20
申请人地址: 200240 上海市闵行区东川路800号
主权项: 1.一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述检测试纸的试纸条包括背衬层,在背衬层上,从一端到另一端依次部分重叠设置样品垫、结合垫、色谱膜和吸收垫,样品垫部分重叠设置在结合垫上,结合垫部分重叠设置在色谱膜上,色谱膜紧贴背衬层位于最底层,吸收垫的一端部分重叠设置在色谱膜上,所述侧流层析检测试纸在使用时,使用预先转录的配体酶与样品共孵育,配体酶对其中的靶标分子进行识别,随后滴加到样品垫上。 2.如权利要求1所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述检测试纸为胶体金侧流层析检测试纸,所述色谱膜为NC膜,结合垫被加入胶体金颗粒的寡聚偶联物溶液并经过干燥处理,胶体金偶联巯基修饰的寡核苷酸,NC膜的试验区和对照区分别被分配生物素-寡核苷酸-T和生物素-寡核苷酸-C溶液并经过干燥处理。 3.如权利要求2所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,结合垫中胶体金颗粒的制备过程如下: 通过柠檬酸钠还原氯金酸溶液并用巯基修饰的寡核苷酸孵育得到胶体金颗粒,并加入NaCl沉淀出未耦合的胶体金颗粒,取出耦合的胶体金颗粒用于检测试纸。 4.如如权利要求2所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,加入生物素-寡核苷酸-T和生物素-寡核苷酸-C前,还按照一定比例分别在生物素-寡核苷酸-T和生物素-寡核苷酸-C中加入链霉亲和素。 5.如权利要求1所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述配体酶的前缀5’端和后缀3’端上分别连接有RNA接头探针。 6.如权利要求5所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述RNA接头探针的设计过程为,使用特定的计算机算法探索已选定配体酶的RNA接头探针的序列空间,并对所有已选定的配体酶以及前缀5’端和后缀3’端上连接有RNA接头探针的已选定配体酶进行二级结构预测,并利用结构预测信息对RNA接头探针进行评估和筛选,选择对选定的配体酶空间结构影响最小的探针。 7.如权利要求6所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述特定的计算机算法为随机采样或全采样算法。 8.如权利要求1所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述配体酶为Gard-337,其DNA模板序列如下: GCUGUCACCGGAAUAGUCGAUGGGUGCCACAUAGCGCCAGAAUCCAGUCUGAUGAGUCUCUCGGCAGGACGAAACAGC。 9.如权利要求8所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,配体酶Gard-337两端连接有RNA接头探针,序列如下: 5’端序列为GGGUGUAAAACCUCCUCGUGU 3’端序列为CAGCUCUGACCCUUUUG。 10.如权利要求2所述的一种基于计算机辅助设计的侧流层析检测试纸,其特征在于,所述配体酶的前缀5’端和后缀3’端上分别连接有RNA接头探针,前缀5’端的探针与胶体金偶联的巯基修饰的寡核苷酸序列互补,后缀3’端的探针与生物素偶联的寡核苷酸序列互补。
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