主权项: |
1、一种竞争性交替结合猝灭探针环介导等温扩增的快速检测方法,其特征在于,按如下步骤
进行:
(1)将细胞悬浮于生理盐水中,离心,去掉上清,然后用磷酸缓冲液冲洗细胞,加入样品预
处理液200~500μl,剧烈震荡混匀;
(2)将震荡混匀后的细胞溶液在100℃加热10~20分钟,冰浴10~20分钟,离心,取上清作
为模板DNA;
(3)在PCR反应管中加入模板DNA,目标DNA序列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,
10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为目标DNA;
(4)竞争DNA序列上游序列的扩增,在PCR反应管中加入模板DNA,竞争DNA上游序列的
上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物
即为竞争DNA序列的上游序列;
(5)竞争DNA序列下游序列的扩展,在PCR反应管中加入模板DNA、竞争DNA序列下游序
列的上游引物和下游引物,dNTPs,rTaq酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR
产物即为竞争DNA序列的下游序列;
(6)竞争DNA的获得,分别回收纯化竞争DNA序列的上游序列和下游序列,混合后稀释,取
5μl作为模板加入到PCR反应管中,然后依次加入上游序列的上游引物和下游序列的下游引物,
dNTPs,Taq Plus扩增酶,10×PCR反应缓冲液,加双蒸水,进行反应,PCR产物即为竞争DNA,
稀释后,通过分光光度计测定竞争DNA的浓度C;
(7)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA
聚合酶,竞争DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计
算FC,FC=Fe/Fb;
(8)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,Bst DNA
聚合酶,目标DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光强度Fe,计
算FT,FT=Fe/Fb;
(9)在PCR管加入交替结合淬灭探针,环介导等温扩增引物混合物,反应缓冲液,BstDNA
聚合酶,浓度为X的模板DNA,加水,65~70℃反应45~50分钟,测定反应前Fb和反应后的荧光
强度Fe;
(10)根据以下公式计算模板DNA的浓度
Fe/Fb=FT[X/(X+C)]+FC[C/(X+C)]=[C(FC-FT)/(X+C)]+FT。 |