专利名称: |
一种通过LC-MS检测核酸表观遗传修饰的方法 |
摘要: |
本发明公开了一种通过LC‑MS检测核酸表观遗传修饰的方法,具体涉及一种检测核糖核酸(RNA)中甲基化修饰的核糖核苷酸的丰度的方法和一种检测脱氧核糖核酸(DNA)中甲基化修饰的脱氧核糖核苷酸的丰度的方法。包括如下步骤:(1)提取生物样本的核酸,进行单核苷酸制备,然后进行去磷酸化,然后纯化单核苷酸,得到上机样本;(2)采用液相色谱‑质谱联用仪对上机样本进行检测,获得丰度结果。本发明对于核酸表观遗传修饰的研究领域具有重大的应用推广价值。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
北京;11 |
申请人: |
中国农业科学院生物技术研究所 |
发明人: |
谷晓峰;张倩 |
专利状态: |
有效 |
发布日期: |
2019-01-01T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN201810896131.0 |
公开号: |
CN108872459A |
代理机构: |
北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 |
代理人: |
关畅;何叶喧 |
分类号: |
G01N30/88(2006.01)I;G;G01;G01N;G01N30;G01N30/88 |
申请人地址: |
100081 北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院生物技术研究所 |
主权项: |
1.一种通过LC‑MS检测生物样本的核糖核酸中N6‑甲基腺嘌呤核糖核苷酸的丰度的方法,包括如下步骤:(1)提取生物样本的RNA,进行单核苷酸制备,然后进行去磷酸化,然后纯化单核苷酸,得到上机样本;(2)采用液相色谱‑质谱联用仪对上机样本进行检测,获得核糖核酸中N6‑甲基腺嘌呤核糖核苷酸的丰度;质谱中,m/z参数设置为282.1‑150.1,CID参数设置为16;液相色谱中,A相为乙腈,B相为0.1%甲酸水溶液;液相色谱中,洗脱过程如下:第0‑7min,A相占流动相的体积比由0线性上升至1%;第7‑10.5min,A相占流动相的体积比由1%线性上升至6%;第10.5‑15min,A相占流动相的体积比由6%线性上升至100%;第15‑20min,A相占流动相的体积份数由100%线性下降至0。 |
所属类别: |
发明专利 |