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原文传递诊断方法和用于诊断的系统

专利名称：	诊断方法和用于诊断的系统
摘要：	用于诊断生物体中的微生物感染的方法，使用该方法，所述微生物感染至少部分地在生物体的细胞物质中作为原体(elementary body)存在。该方法包括以下步骤：(1)提供来自生物体的细胞物质的样品；(2)处理样品以获得富集了原体的测试组合物，只要样品包含任何原体；以及(3)使一定体积的包含至多预先确定的最大数目的原体的测试组合物经历MALDI质谱分析方法以鉴定微生物感染的存在。样品处理更特别地涉及细胞裂解和从裂解的细胞物质分离原体。随后，使原体(和附着至其的任何其他物质)与基质材料接触，促进MALDI质谱分析。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	荷兰;NL
申请人：	拜斯帕尔有限公司
发明人：	雷内·雷蒙德·帕钦;瑟法斯·安东尼·摩尔
专利状态：	有效
申请日期：	2018-03-01T00:00:00+0800
发布日期：	2019-11-01T00:00:00+0800
申请号：	CN201880015488.1
公开号：	CN110402392A
代理机构：	北京安信方达知识产权代理有限公司
代理人：	刘小立;郑霞
分类号：	G01N33/569(2006.01);G;G01;G01N;G01N33
申请人地址：	荷兰莱顿
主权项：	1.用于诊断生物体中的微生物感染的方法，其中所述微生物感染至少部分地在所述生物体的细胞物质中作为原体存在，所述方法包括以下步骤： -提供来自所述生物体的细胞物质的样品； -处理所述样品以获得富集了原体的测试组合物，只要所述样品包含任何原体； -使一定体积的包含至多预先确定的最大数目的原体的所述测试组合物经历MALDI质谱分析方法以鉴定所述微生物感染的存在。 2.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法还包括产生所述测试组合物的液滴的步骤，所述液滴是连续地经历所述MALDI质谱分析方法的体积。 3.根据权利要求1或2所述的方法，其中每体积的原体的所述预先确定的最大数目是10，优选地是5。 4.根据权利要求3所述的方法，其中每个体积包含至多2个原体，并且其中优选地一个液滴包含单个原体。 5.根据权利要求2-4中任一项所述的方法，其中使所产生的液滴经历选择步骤，所述选择步骤包括液滴的光学图像的配准和基于对所述光学图像的分析选择液滴。 6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述样品的处理包括以下步骤：裂解所述细胞物质，以及将所述原体与其他裂解的物质分离。 7.根据权利要求6所述的方法，其中所述裂解通过声处理来进行。 8.根据权利要求6-7所述的方法，其中所述分离包括离心处理。 9.根据权利要求8所述的方法，其中所述离心处理提供包含与细胞碎片分离的所述原体的上清液。 10.根据权利要求6-9中任一项所述的方法，所述方法还包括浓缩所分离的原体的组合物的步骤。 11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述样品的处理还包括将基质材料的组合物添加至所富集的样品，从而产生所述测试组合物。 12.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述微生物感染由至少一种细胞内细菌物种产生。 13.根据权利要求12所述的方法，其中所述细菌物种属于衣原体属(Chlamydia)，并且更具体地为沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)。 14.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述微生物感染是无症状的。 15.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述MALDI质谱分析方法包括： -处理所述一定体积的所述测试组合物，优选地液滴，以使其基质材料结晶到包含在所述一定体积中的至少一个原体上，从而获得分析物； -使所述分析物的至少一部分电离； -使用飞行时间检测器分离电离的组分以获得质谱； -将所述质谱与至少一个参考进行比较，以鉴定所述微生物感染。 16.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述样品的提供是来自包含先前收集的材料的容器的样品的提供。 17.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物体是哺乳动物，优选地人类。 18.一种用于诊断微生物感染的系统，所述微生物感染至少部分地在生物体的细胞物质中作为原体存在，用于诊断的所述系统包括以下的组合： -用于裂解细胞物质的样品的装置； -分离装置，所述分离装置用于将原体与通过细胞裂解获得的其他物质分离； -混合装置，所述混合装置用于将基质材料的组合物与如此分离的原体混合，以获得包含所述原体的测试组合物； -分配单元，所述分配单元用于分配一定体积的包含预先确定的最大数目的原体的所述测试组合物， -MALDI质谱仪，所述MALDI质谱仪被配置用于产生所述测试组合物的质谱，以及 -处理器，所述处理器用于基于多于一个个体体积的质谱产生均值谱并且用于将所述均值谱与通常来自数据库的参考进行比较。 19.根据权利要求18所述的系统，其中所述分配单元是用于产生所述测试组合物的液滴的液滴产生器。 20.根据权利要求19所述的系统，所述系统还包括光学图像分析装置，所述光学图像分析装置包括光学图像记录器和用于分析记录的光学图像的处理装置。 21.根据权利要求20所述的系统，所述系统还包括液滴去除装置，所述液滴去除装置基于通过所述处理装置的所述分析而被驱动。 22.根据权利要求18-21中任一项所述的系统，其中所述裂解装置包括声处理装置。 23.根据权利要求18-22中任一项所述的系统，其中所述分离装置包括离心机。 24.根据权利要求18-23中任一项所述的系统用于鉴定原体和/或诊断微生物感染的用途。
所属类别：	发明专利