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原文传递 一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取及检测分析方法
专利名称: 一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取及检测分析方法
摘要: 本发明具体涉及一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取及检测分析方法。本发明采用丙酮沉淀法,充分裂解后的蛋白溶液加入冷丙酮和30mM DTT,涡旋混匀,‑20℃沉淀,离心时去掉上清后采用质谱更兼容的溶液重悬蛋白,SDS等表面活性剂能够和蛋白结合,丙酮沉淀蛋白时会一起沉淀下来,所以丙酮沉淀一次只能去掉部分的SDS,待重悬的蛋白进行还原烷基化后,再次加入冷丙酮和10mM DTT,‑20℃沉淀,离心去掉上清后再次采用质谱更兼容的溶液重悬蛋白,经过两次丙酮沉淀与裂解液重悬置换,SDS对后续实验的影响基本消除,并且每个样品只需3ml左右的丙酮,成本大约0.1元,相较于超滤管,节省了更多成本。
专利类型: 发明专利
国家地区组织代码: 湖北;42
申请人: 武汉金开瑞生物工程有限公司
发明人: 陈亚运;华权高;李立;赵海义;鲁思琴;李如萍;舒芹;张雪娇
专利状态: 有效
申请日期: 2019-08-28T00:00:00+0800
发布日期: 2019-11-26T00:00:00+0800
申请号: CN201910804757.9
公开号: CN110501437A
代理机构: 武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙)
代理人: 严超
分类号: G01N30/02(2006.01);G;G01;G01N;G01N30
申请人地址: 430000 湖北省武汉市东湖开发区高新大道666号武汉国家生物产业基地项目B、C、D区研发楼B1楼
主权项: 1.一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:去石蜡、冷冻干燥、裂解、加热、离心、丙酮沉淀、离心复溶、还原、烷基化、二次丙酮沉淀、离心。 2.根据权利要求1所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,裂解的条件为:用液氮研磨组织,完全磨成粉末后加入裂解液,混匀后冰浴超声破碎。 3.根据权利要求2所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,裂解液包括0.1M Tris-HCl、0.1M DTT、1mM PMSF、2mM EDTA,pH为8.0,超声破碎的条件为:超声破碎2秒,间歇时间为3秒,功率为150-250W,超声裂解的时间为10-20min。 4.根据权利要求1所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,加热的条件为:加入终浓度为4%的SDS,95-105℃金属浴震荡80-100min。 5.根据权利要求1所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,丙酮沉淀的条件为:加入3-5倍体积的冷丙酮,再加入30mM DTT,混匀,-20℃静置沉淀;二次丙酮沉淀的条件为:加入3-5倍体积的冷丙酮,同时加入10mM DTT,混匀,-20℃静置沉淀。 6.根据权利要求1所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,离心复溶的条件为:离心后去上清,沉淀中加入含有8M尿素、0.1M TEAB的溶液进行溶解。 7.根据权利要求1所述的一种石蜡包埋样本中蛋白质的提取方法,其特征在于,包括以下步骤: 1)去石蜡:去除石蜡包埋样本中的石蜡; 2)冷冻干燥:将去除石蜡的样本进行冷冻干燥至完全干燥; 3)裂解:先液氮研磨再加入裂解液最后采用冰浴超声破碎; 4)加热:向裂解后的样品中加入终浓度为4%的SDS混匀,95-105℃金属浴震荡80-100min,冷却至室温; 5)离心:取上清; 6)丙酮沉淀:加入冷丙酮,再加入30mM DTT,混匀后,-20℃静置沉淀; 7)离心复溶:离心取上清,沉淀风干后加入含有8M尿素、0.1M TEAB的溶液进行溶解; 8)还原:加入0.5-1.5%体积比的1M DTT,50-70℃水浴25-40min; 9)烷基化:加入8-12%体积比的0.55M IAM,常温暗室静置25-35min; 10)二次丙酮沉淀:加入冷丙酮,同时加入10mM DTT,混匀,-20℃静置沉淀; 11)离心:离心去上清,沉淀即为提取得到的蛋白质。 8.如权利要求1所述的石蜡包埋样本中蛋白质的检测分析方法,其特征在于,按照上述方法提取石蜡包埋样本中的蛋白质,对提取得到的蛋白质依次进行复溶、酶解和脱盐处理,经过脱盐处理后的样品进行HPLC分组分、质谱检测和数据分析。 9.根据权利要求8所述的石蜡包埋样本中蛋白质的检测分析方法,其特征在于,酶解包括以下步骤:取复溶后的蛋白质溶液,依次加入TEAB、CaCl2溶液、胰酶,震荡混匀离心,37℃水浴过夜。 10.根据权利要求8所述的石蜡包埋样本中蛋白质的检测分析方法,其特征在于,脱盐处理包括以下步骤: 1)将水浴过夜后的样本离心取上清,加入FA酸化,震荡混匀后离心取上清备用; 2)采用甲醇和FA活化和酸化C18柱料; 3)将酸化后的样品加入步骤2)中的柱料中缓慢旋转反应; 4)用FA和ACN溶液清洗,离心收集上清液。
所属类别: 发明专利
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