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原文传递一种胆管癌诊断标志物及其筛选方法和应用

专利名称：	一种胆管癌诊断标志物及其筛选方法和应用
摘要：	本发明涉及临床检验诊断领域，具体涉及一种胆管癌诊断标志物及其筛选方法和应用，所述的诊断标志物包括以下6种标志物组成的组合：簇集蛋白，间接胆红素，低密度脂蛋白胆固醇，γ‑谷氨酰基转移酶，糖类抗原19‑9，甘油三酯；本发明采用蛋白质组学技术以及人工智能数据分析技术得到了众多适合于胆管癌诊断的诊断标志物，所述的诊断标志物包括胆汁和血清中的标志物，标志物组合的AUC明显高于单独的CLU，本发明的诊断标志物筛选方法可操作性强，模型构建方法简单，所得诊断标志物灵敏度高，特异性好，适合于胆管癌的诊断，能够很好地弥补现有影像学诊断模式的不足，本发明诊断简单快速，有利于胆管癌的早诊早治，具有很好的临床使用和推广价值。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	甘肃;62
申请人：	兰州大学第一医院
发明人：	孟文勃;高龙;岳平;李书艳
专利状态：	有效
申请日期：	2022-09-28T00:00:00+0800
发布日期：	2023-01-06T00:00:00+0800
申请号：	CN202211197099.X
公开号：	CN115575635A
代理机构：	北京力量专利代理事务所(特殊普通合伙)
代理人：	戴治娟
分类号：	G01N33/574;G01N33/573;G01N33/68;G01N33/72;G01N33/92;G01N30/02;G01N30/06;G01N30/72;G01N30/86;G16H50/20;G;G01;G16;G01N;G16H;G01N33;G01N30;G16H50;G01N33/574;G01N33/573;G01N33/68;G01N33/72;G01N33/92;G01N30/02;G01N30/06;G01N30/72;G01N30/86;G16H50/20
申请人地址：	730000 甘肃省兰州市城关区东岗西路1号
主权项：	1.一种胆管癌的诊断标志物，其特征在于，所述的诊断标志物包括以下3种物质组成的组合：簇集蛋白(CLU)，间接胆红素(IBIL)，低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)。 2.如权利要求1所述的诊断标志物，其特征在于，所述的诊断标志物包括以下4种物质的组合：簇集蛋白(CLU)，间接胆红素(IBIL)，低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)，γ-谷氨酰基转移酶(GGT)。 3.如权利要求2所述的诊断标志物，其特征在于，所述的诊断标志物包括以下5种物质的组合：簇集蛋白(CLU)，间接胆红素(IBIL)，低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)，γ-谷氨酰基转移酶(GGT)，糖类抗原19-9(CA19-9)。 4.如权利要求3所述的诊断标志物，其特征在于，所述的诊断标志物包括以下6种物质的组合：簇集蛋白(CLU)，间接胆红素(IBIL)，低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)，γ-谷氨酰基转移酶(GGT)，糖类抗原19-9(CA19-9)，甘油三酯(TG)。 5.一种如权利要求1-4任一项所述的胆管癌诊断标志物的筛选方法，其特征在于，包含以下步骤： (1)胆汁标志物的筛选：采用液相色谱质谱联用技术对胆汁和细胞上清液进行蛋白质组学分析，分析鉴定胆管癌和对照组之间的差异表达蛋白；对胆管癌的胆汁和细胞上清液中异常高表达的蛋白取交集，得到胆汁标志物； (2)对步骤(1)筛选得到的胆汁标志物与血清指标混合，使用随机森林方法建立分类预测模型，并将每个标志物按照交叉验证集中预测结果的重要性进行排序，利用R语言的glment软件包，基于10倍交叉验证分类法，将287例患者的所有指标数据分为10组不重叠的部分，其中2组用于测试队列，8组用于训练队列； (3)根据基尼指数≥0.25筛选出12个标志物，将所述的12种标志物纳入Lasso分类器训练集的初始输入变量，只有对分类有贡献的变量被赋予非零权重；当增加标志物的数量，Lasso分类器中准确度、灵敏度和特异度不再上升时，Lasso分类器的性能在测试集上达到最佳的准确度、灵敏度和特异度； (4)引用受试者工作特征ROC曲线来评价Lasso模型的最佳诊断性能，以ROC曲线上准确度、灵敏度和特异度最佳为截断点，得到相对最优特征数及组合方式； (5)在外部验证集中利用ROC曲线验证步骤(4)得到的相对最优特征数及组合方式，得到适合于胆管癌诊断的标志物组合。 6.如权利要求5所述的筛选方法，其特征在于，所述的随机森林和LASSO在glment版本4.1-3中进行。 7.如权利要求5所述的筛选方法，其特征在于，步骤(2)中共种植了2000棵决策树，所述的血清指标包括37个血液生化指标、24个常规血液指标和两个肿瘤生物标志物。 8.如权利要求1-4任一项所述的诊断标志物在制备用于胆管癌诊断产品中的应用。 9.如权利要求8所述的应用，其特征在于，所述的诊断产品包括试剂盒、试剂或芯片。 10.一种胆管癌早期诊断试剂盒，其特征在于，包含权利要求1-4任一项所述的诊断标志物。