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原文传递细胞分析

专利名称：	细胞分析
摘要：	描述了研究真核细胞对扰动的反应，或将真核细胞或细胞系分层成一个或多个亚组的方法。这些方法涉及以相同方式扰动细胞或细胞系文库，并观察细胞对相同扰动如何反应。观察可以通过高通量筛选方法，例如，cell painting；并且扰动可以是，例如，暴露于治疗剂。这些方法可用于对对给定治疗剂有类似反应的细胞或细胞系进行分组，其可用于识别患者组和选择合适的治疗。
专利类型：	发明专利
申请人：	敦提大学
发明人：	安格斯·伊恩·拉蒙德;贾森·斯韦德洛;梅尔波梅尼·普拉塔尼
专利状态：	有效
申请日期：	2022-03-08T00:00:00+0800
发布日期：	2023-11-10T00:00:00+0800
申请号：	CN202280019872.5
公开号：	CN117043597A
代理机构：	中科专利商标代理有限责任公司
代理人：	乔献丽;张莹
分类号：	G01N33/50;G;G01;G01N;G01N33;G01N33/50
申请人地址：	英国敦提
主权项：	1.研究真核细胞对测试化合物的反应的方法，所述方法包括：提供从一个或多个供体获得的真核干细胞或细胞系的文库，其中所述文库内的每个真核干细胞或细胞系是相同细胞类型；使所述文库内的每个真核干细胞或细胞系与所述测试化合物以相同方式接触；和观察所述文库内的每个真核干细胞或细胞系对所述测试化合物如何发生表型反应，以识别和分组对所述测试化合物反应相似的细胞或细胞系。 2.将从一个或多个供体获得的真核细胞或细胞系分层成一个或多个组的方法，其中每个所述真核细胞或细胞系是相同细胞类型的干细胞，所述方法包括；使每个真核干细胞或细胞系与测试化合物以相同方式接触并观察每个真核干细胞或细胞系对相同测试化合物如何反应；和基于观察到的每个真核干细胞或细胞系的表型反应，将每个真核干细胞或细胞系分层成所述一个或多个组。 3.根据权利要求2所述的方法，其中每个所述组包含对所述相同测试化合物的表型反应相似的细胞或细胞系或由其组成。 4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述干细胞或细胞系包含诱导性多能干细胞(iPSC)或基本上由其组成。 5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述细胞或细胞系源自从患有与已知或候选突变相关的一种或多种疾病的供体获得的细胞。 6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述细胞或细胞系已经人工修饰以改变基因型。 7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中观察反应包括将与测试化合物接触之前的初始细胞或细胞系状况与与测试化合物接触后的细胞或细胞系状况进行比较。 8.根据权利要求7所述的方法，其中所述状况包括所述细胞或细胞系的基于图像的表型测量；优选地一种或多种亚细胞组分的测量。 9.根据权利要求7或8所述的方法，其中所述状况包括所述细胞或细胞系的分子描述。 10.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述测试化合物包含以下中的一种或多种：小分子药物化合物，或候选药物化合物，或天然产物；蛋白/肽，或RNA大分子；用于通过例如基因产物耗竭、基因突变、敲除和敲入对所述细胞或细胞系进行基因修饰的试剂；或感染剂。 11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中进行所述方法以分析人群中与相关临床问题有关的预期差异反应，所述相关临床问题例如药物功效、灵敏度、生物标志物变化或对感染剂的灵敏度。 12.根据前述权利要求中任一项所述的方法，进一步包括进一步将所述分层的或分组的细胞与基因元数据相关联。 13.根据前述权利要求中任一项所述的方法，进一步包括分析所述分层的或分组的细胞，以识别和表征与对特定扰动的限定反应相关的蛋白特征。 14.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法用于临床试验的设计。 15.选择参与临床试验的患者的方法，所述方法包括对供体细胞或细胞系进行前述权利要求中任一项所述的方法，以获得分层的或分组的细胞群；将潜在临床试验受试者的特征与所述分层的或分组的细胞的相应特征进行比较；和基于与所述分层的或分组的细胞的特征的相似性，选择或不选择所述临床试验的受试者。 16.选择用于患者的治疗干预的方法，所述方法包括对供体细胞或细胞系进行权利要求1-14中任一项所述的方法，以获得分层的或分组的细胞群；将所述患者的特征与所述分层的或分组的细胞的相应特征进行比较；和基于与所述分层的或分组的细胞的特征的相似性，选择用于所述患者的合适治疗干预。
所属类别：	发明专利