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原文传递 一种难治性高血压特征蛋白标志物群及其筛查方法和应用
专利名称: 一种难治性高血压特征蛋白标志物群及其筛查方法和应用
摘要: 本发明公开了一种难治性高血压特征蛋白标志物群筛查方法,并公开了一种难治性高血压特征蛋白标志物群,包括COL6A3、CSF1R、HSPG2、ITGA2、PDGFB、THBS1、或vWF 7个蛋白任意组合。本发明公开的蛋白标志物群可在制备识别难治性高血压的检测试剂盒和/或芯片中的应用,并可制备试剂盒和/或芯片相关产品。本发明在相关领域的应用有利于难治性高血压的诊断及判断预后,为难治性高血压的精准治疗提供强有力的支撑。
专利类型: 发明专利
国家地区组织代码: 山东;37
申请人: 山东中医药大学
发明人: 杨雯晴;李运伦;王昱琪;郇家铭
专利状态: 有效
申请日期: 2023-08-03T00:00:00+0800
发布日期: 2023-11-07T00:00:00+0800
申请号: CN202310967523.2
公开号: CN117007817A
代理机构: 北京中知慧专利代理事务所(普通合伙)
代理人: 何楠
分类号: G01N33/68;G;G01;G01N;G01N33;G01N33/68
申请人地址: 250000 山东省济南市经十路16369号
主权项: 1.一种难治性高血压特征蛋白标志物群筛查方法,其特征在于包括以下步骤: (1)样本采集 招募10名难治性高血压住院患者,设为RH组,另外招募同时期10名健康人,设为N组;收集RH组和N组试验参与者的人口学信息;并在清晨空腹状态下采集血液标本,用于蛋白质组学检验以及血常规、生化、甲状腺功能化验;采集尿液、粪便标本用于尿常规和大便常规; (2)蛋白质组学检验 对血液标本进行预处理,去除干扰物质,并进行蛋白质消化、肽段纯化等步骤进行样品准备用于质谱分析;使用数据非依赖性的扫描模式依据质荷比采集所有母离子的碎片,进行离子信息进行蛋白定性和定量;同时使用数据依赖性的扫描模式进行全扫描采集母离子信号生成一级谱图,二级质谱依次选择一级谱图中信号强度排序为top10/20/40的峰进行碎裂并采集对应的子离子信息; 对DDA扫描方式得到的下机谱图Raw文件,通过Proteome Discoverer进行搜库解谱,将谱图信息转化为蛋白质信息,同时进行DDA数据质控,将质控后的数据导入Spectronaut构建出一个真实的谱图库DDA library;另一方面,通过Spectronaut将DDA扫描方式得到的下机谱图Raw文件比对到DDA library进行蛋白鉴定; (3)蛋白质筛选 以质谱分析鉴定到的所有蛋白表达量为数据,利用单因素方差分析对样本进行多组比较,经BH矫正,以P值0.05为阈值,对蛋白进行差异表达的筛选,对得到的蛋白按样本间的表达量进行分类。 (4)蛋白质功能注释 以R(4.2.2)中的org.Hs.eg.db包(3.10.0)进行蛋白注释,使用clusterProfiler包(3.14.3)进行KEGG富集分析,采用超几何分布,设置Q<0.05为显著富集通路;同时将使用Metasacpe进行GO条目富集; (5)建立蛋白质相互作用网络 将RH差异表达蛋白输入STRING其中的智人数据库,建立蛋白质相互作用网络,用于分析RH差异表达蛋白间等相互作用。 (6)WGCNA分析 使用WGCNA分析不同患者之间的蛋白表达模式,鉴定高度协同的蛋白集合。根据分析患者化验结果中白细胞、促甲状腺激素、游离甲状腺素、游离三碘甲状腺原氨酸、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、谷氨酰胺转肽酶等指标与差异蛋白关联规则,对蛋白进行功能划分,从而验证各个潜在生物标志物的调控方向,本发明使用R(4.2.2)中的WGCNA(1.72-1)包实现; (7)统计学分析 采用R(4.2.2)分析数据;对于连续性数据若同时满足正态性和方差齐性,应用独立样本t检验比较两组数据之间的差异,否则采用非参数检验。对于二分类变量,采用卡方检验;以P<0.05为统计学差异。 2.一种难治性高血压特征蛋白标志物群,其特征在于包括COL6A3、CSF1R、HSPG2、ITGA2、PDGFB、THBS1、或vWF 7个蛋白任意组合。 3.根据权利要求2所述的一种难治性高血压特征蛋白标志物群,其特征在于包括COL6A3、CSF1R、HSPG2、ITGA2、PDGFB、THBS1、和vWF7个蛋白。 4.根据权利要求2所述的一种难治性高血压特征蛋白标志物群在制备识别难治性高血压的检测试剂盒和/或芯片中的应用。 5.根据权利要求5所述的一种难治性高血压特征蛋白标志物群在制备识别难治性高血压检测试剂盒和/或芯片中应用的产品,其特征在于,所述产品包括检测所述生物标志物表达水平的试剂。 6.根据权利要求5所述应用的产品,其特征在于,所述试剂包括检测引物和/或探针。 7.根据权利要求5所述应用的产品,其特征在于,所述产品是试剂盒或基因芯片。
所属类别: 发明专利
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