专利名称: |
一种用于儿童个性化教育和健康指导的基因检测方法 |
摘要: |
本发明涉及一种用于儿童个性化教育和健康指导的基因检测方法。根据最新的分子生
物学领域科学研究成果,选择了41个可用于儿童个性化教育指导的基因多态现象(位点),
利用微测序技术进行引物、探针设计以及实验验证。这些检测结果可以结合儿童的性别、
年龄等特性以及相关环境因素(家庭背景、教育背景等)进行综合评估,为儿童个性化教
育和培养提供指导意见。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
上海;31 |
申请人: |
上海中优医药高科技有限公司;中国优生优育基因科学专家指导中心 |
发明人: |
王 校;张 奕;毛丹丹 |
专利状态: |
有效 |
申请日期: |
2009-03-18T00:00:00+0800 |
发布日期: |
2019-01-01T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN200910047750.3 |
公开号: |
CN101560555 |
代理机构: |
上海申汇专利代理有限公司 |
代理人: |
翁若莹 |
分类号: |
C12Q1/68(2006.01)I |
申请人地址: |
200433上海市杨浦区国泰路11号701室 |
主权项: |
1.一种用于儿童个性化教育和健康指导的基因检测方法,其特征在于:
步骤1.检测的样品类型与采样方法:用采样拭在20-30被测者口腔中分别左右两腮
至少需要各上下刮40次以上,以保证采集到足量的细胞样本;
步骤2.基因组DNA的抽提方法:采用硅胶吸附法抽提每一个口腔上皮细胞样本的基
因组DNA,时间为2小时-2.5小时,共抽提20-30个被测者样本,经电泳检测后,用肉
眼可见清晰白色条带即可判断获得的DNA能进入下一步检测;
步骤3:荧光定量PCR反应:将每一个被测者样本分别放入41个反应孔,同时检测
41个位点,即血管紧张素转化酶(ACE)SEQ ID NO1:283bp I/D;α-辅肌动蛋白3(ACTN3)
SEQ ID NO2:Arg577Ter;α2A肾上腺素受体(ADRA2A)SEQ ID NO3:C-1291G;β2
肾上腺素能受体(ADRB2)SEQ ID NO4:Arg15Gly;δ氨基-γ酮戊酸脱氢酶(ALAD)SEQ
ID NO5:Asn68Lys;乙醛脱氢酶2(ALDH2)SEQ ID NO6:Lys504Glu;锚蛋白重复激酶
结构域1(ANKK1)SEQ ID NO7:TaqI;载脂蛋白E(APOE)SEQ ID NO8:Cys112Arg;
脑神经营养因子(BDNF)SEQ ID NO9:Val66Met;过氧化氢酶(CAT)SEQ ID NO 10:
G-844A;捷状神经营养因子(CNTF)SEQ ID NO 11:G1275A;儿茶酚-氧位-甲基转移酶
(COMT)SEQ ID NO 12:Val158Met;C-反应蛋白(CRP)SEQ ID NO 13:G219A;细
胞色素P450 1A2(CYP1A2)SEQ ID NO 14:C-729T;细胞色素P4501A2(CYP1A2)SEQ
ID NO 15:G-3858A;多巴胺β羟化酶(DBH)SEQ ID NO 16:C-1021T;多巴胺β羟化
酶(DBH)SEQ IDNO 17:G444A;多巴胺受体D3(DRD3)SEQ ID NO 18:Ser9Gly;
G蛋白偶联受体54(GPR54)SEQ ID NO 19;谷胱甘肽硫转移酶P1(GSTP1)SEQ ID NO
20:Val105Ile;5-羟色胺受体1B(HTR1B)SEQ ID NO 21:A-161T;白介素1B(IL1B)
SEQ ID NO 22:C-511T;IL1RAPL1 SEQ ID NO 23;白介素6(IL6)SEQ ID NO 24:
G-174C;基质γ-羧基谷氨酸蛋白(MGP)SEQ ID NO 25:T-138C;亚甲基四氢叶酸还原
酶(MTHFR)SEQ ID NO 26:C677T;亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)SEQ ID NO 27:
A1298C;甲硫氨酸合酶(MTR)SEQ ID NO 28:Gly919Asp;甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)
SEQ ID NO 29:Met22Ile;内皮一氧化氮合成酶3(NOS3)SEQ ID NO 30:Glu298Asp;
8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(OGG1)SEQ ID NO 31:Ser326Cys;μ阿片受体(OPRM1)
SEQ ID NO 32:A118G;PAX6 SEQ ID NO 33:IVS9-12C/T;I型二乙基对氧磷酸酯酶
(PON1) SEQ ID NO 34:Arg192Gln;SLC6A3 SEQ ID NO 35:MspI;TNFRSF11B SEQ
ID NO 36:A163G;色胺酸羟化酶1(TPH1)SEQ ID NO 37:A218C;维生素D受体(VDR)
SEQ ID NO 38:BsmI;维生素D受体(VDR)SEQ ID NO 39:Fok I;维生素D受体(VDR)
SEQ ID NO 40:Ile352Ile;WWC1 SEQ ID NO 41;20-30个被测者样本就有820-1230个
反应孔,另外根据实验需要增设不含DNA模版的NTC空白对照孔;
每一个反应孔的基因分型可以根据下表的引物和探针设计,采用 id="icf0001" file="A2009100477500003C1.tif" wi="23" he="3" top= "62" left = "151" img-content="drawing" img-format="tif" orientation="portrait" inline="yes"/>技术,
进行检测试剂合成;
在每一个反应孔中加入试剂为荧光定量PCR反应体系,总体积为10μl,即浓度为
20ng/μl的DNA模板2μl、1μl 10X荧光定量PCR反应缓冲液ABI id="icf0002" file="A2009100477500003C2.tif" wi="16" he="3" top= "86" left = "142" img-content="drawing" img-format="tif" orientation="portrait" inline="yes"/>MGB、0.1μl 25mM
d NTP合成DNA的四种脱氧核苷酸底物、0.5μl 25mM MgCl2溶液、O.02μl(5units/μl)Taq
DNA聚合酶、去离子水4.98μl、41个位点分别采用不同的正向引物(20μM,0.225μl)、反
向引物(20μM,0.225μl)、VIC荧光探针(10μM,0.25μl)和FAM荧光探针(10μM,0.25μl)
工具进行检测(详见下表); |
所属类别: |
发明专利 |