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原文传递用于诊断肺癌的组合物、方法和试剂盒

专利名称：	用于诊断肺癌的组合物、方法和试剂盒
摘要：	提供了用于鉴定在具有第一肺病症的受试者中与健康受试者或具有第二肺病症的受试者中表现出差异表达的生物标记物蛋白的方法。还提供了包含这些生物标记物蛋白的组合物和使用这些生物标记物蛋白或其组以诊断、分类和监测各种肺病的方法。本文提供的方法和组合物可用于诊断或分类受试者为患有肺癌或非癌症病症，以及区分不同类型的癌症(例如恶性与良性、SCLC与NSCLC)。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	美国;US
申请人：	佰欧迪塞克斯公司
发明人：	P.E.基尔尼;K.C.方;X-J.李;C.海沃德
专利状态：	有效
申请日期：	2017-05-05T00:00:00+0800
发布日期：	2019-08-09T00:00:00+0800
申请号：	CN201780041871.X
公开号：	CN110114680A
代理机构：	中国专利代理(香港)有限公司
代理人：	彭昶;黄希贵
分类号：	G01N33/574(2006.01);G;G01;G01N;G01N33
申请人地址：	美国科罗拉多州
主权项：	1.一种确定受试者的肺结节不是肺癌的可能性的方法，包括： (a)使得自受试者的血液样品与蛋白水解酶接触以从血液样品中存在的一组蛋白质产生肽片段，其中所述组包含选自BGH3、C163A、LG3BP、GELS、IBP3、LUM、MASP1、PEDF和S10A6的两种蛋白质； (b)将来自步骤(a)的组的产生的肽片段与标记的合成肽片段组合，所述合成肽片段对应于来自所述组的产生的肽片段； (c)进行选择的反应监测质谱法以测量来自步骤(b)的肽片段的丰度； (d)基于步骤(c)的肽片段测量计算肺癌评分的概率；和 (e)如果步骤(d)中的评分低于预定分数，则排除受试者的肺癌。 2.根据权利要求1所述的方法，其中所述组包括LG3BP和C163A。 3.根据权利要求1所述的方法，其中当排除肺癌时，定期监测所述受试者。 4.根据权利要求1所述的方法，其中所述受试者具有低至中度的癌症风险。 5.根据权利要求1所述的方法，还包括医生对癌症风险的评估。 6.根据权利要求5所述的方法，其中所述受试者被指定为医生对癌症风险的评估在0到1之间。 7.根据权利要求6所述的方法，其中所述癌症风险由确定为以下的癌症风险预测因子Ci(k)确定其中判定阈值Ti是结节不大于15mm的患者的{Si(k)}的中值。 8.根据权利要求3所述的方法，其中所述定期监测是肺功能测试(PFT)、肺成像、活组织检查或其任何组合。 9.根据权利要求8所述的方法，其中所述肺成像是X射线、胸部计算机断层摄影(CT)扫描或正电子发射断层摄影(PET)扫描。 10.根据权利要求1所述的方法，其中所述肺结节的直径小于或等于3cm。 11.根据权利要求1所述的方法，其中所述肺结节的直径为约0.8cm至3.0cm。 12.根据权利要求1所述的方法，其中所述选择的反应监测质谱法使用特异性结合待检测的肽片段的化合物进行。 13.根据权利要求1所述的方法，所述组包括LG3BP和C163A并且反转比为0.07。 14.根据权利要求1所述的方法，所述组包含BGH3和C163A，并且所述反转比为0.06。 15.根据权利要求1所述的方法，所述组包括LG3BP和GELS并且反转比为0.05。 16.根据权利要求1所述的方法，所述组包括LG3BP和IBP3并且反转比为0.07。 17.根据权利要求1所述的方法，所述组包括LUM和C163A并且反转比为0.06。 18.根据权利要求1所述的方法，所述组包括MASP1和C163A并且反转比为0.07。 19.根据权利要求1所述的方法，所述组包括MASP1和IBP3并且反转比为0.06。 20.根据权利要求1所述的方法，所述组包括PEDF和C163A并且反转比为0.07。 21.根据权利要求1所述的方法，所述组包括S10A6和C163A并且反转比为0.06。 22.根据权利要求1所述的方法，所述组包括S10A6和ENPL并且反转比为0.06。 23.根据权利要求1所述的方法，所述组包括LUM和GELS并且反转比为0.02。 24.一种确定受试者的肺结节是肺癌的可能性的方法，包括： (a)使得自受试者的血液样品与蛋白水解酶接触以从血液样品中存在的一组蛋白质产生肽片段，其中所述组包含选自BGH3、C163A、LG3BP、GELS、IBP3、LUM、MASP1、PEDF和S10A6的两种蛋白质； (b)将来自步骤(a)的组的产生的肽片段与标记的合成肽片段组合，所述合成肽片段对应于来自所述组的产生的肽片段； (c)进行选择的反应监测质谱法以测量来自步骤(b)的肽片段的丰度； (d)基于步骤(c)的肽片段测量计算肺癌评分的概率；和 (e)如果步骤(d)中的分数等于或高于预定分数，则划入受试者的肺癌。 25.根据权利要求24所述的方法，其中所述组包括LG3BP和C 163A。 26.根据权利要求24所述的方法，其中当划入肺癌时，定期监测受试者。 27.根据权利要求24所述的方法，其中所述受试者具有低至中度的癌症风险。 28.根据权利要求24所述的方法，还包括医生对癌症风险的评估。 29.根据权利要求28所述的方法，其中所述受试者被指定为医生对癌症风险的评估在0到1之间。 30.根据权利要求29所述的方法，其中所述癌症风险由确定为以下的癌症风险预测因子Ci(k)确定其中判定阈值Ti是结节不大于15mm的患者的{Si(k)}的中值。
所属类别：	发明专利