专利名称: |
利用DSN酶和DNAzyme的DNA自组装电化学生物传感器的制备方法 |
摘要: |
本发明公开了一种利用DSN酶和DNAzyme的DNA自组装电化学生物传感器的制备方法,利用了DNA与RNA碱基互补配对原则,首先,设计了具有发夹结构的功能探针,当目标物(待测样品microRNA)存在时,特异性核酸内切酶(DSN酶)切割DNA‑RNA杂交体的DNA部分得到8‑17DNAzyme。然后,8‑17DNAzyme能特异性识别固定在电极表面的H2序列中腺嘌呤核糖核苷酸rA位点进行切割。最后,电极表面被DNAzyme特异性切割后与电极表面相连的DNA序列依次与序列Link1、Link2、H3和H4自组装形成电化学生物传感器用于目标检测。所建立的方法灵敏度高,可用于复杂体系的microRNA的直接检测。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
福建;35 |
申请人: |
福州大学 |
发明人: |
陈宪;李璟 |
专利状态: |
有效 |
申请日期: |
2019-07-17T00:00:00+0800 |
发布日期: |
2019-09-24T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN201910647121.8 |
公开号: |
CN110274941A |
代理机构: |
福州元创专利商标代理有限公司 |
代理人: |
饶文君;蔡学俊 |
分类号: |
G01N27/327(2006.01);G;G01;G01N;G01N27 |
申请人地址: |
350108 福建省福州市闽侯县上街镇福州大学城学院路2号福州大学新区 |
主权项: |
1.一种利用DSN酶和DNAzyme的DNA自组装电化学生物传感器的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:首先设计能与目标microRNA碱基互补配对且含8-17DNAzyme序列的双功能探针H1;双特异性核酸内切酶特异性切割DNA-RNA杂交的DNA部分, H1探针被切割得到游离的8-17DNAzyme序列,而microRNA被释放出来继续与未反应H1探针杂交循环切割,实现第一次目标循环;然后将发夹探针H2固定在金电极上;当金属离子存在时,前述8-17DNAzyme会特异性识别H2 序列中腺嘌呤核糖核苷酸rA位点并特异性切割,H2探针被切断成两部分,一部分与电极相连,一部分为游离的碱基序列,同时释放8-17DNAzyme继续切割未反应的电极表面的H2探针实现第二次循环放大;电极表面的H2被DNAzyme切断后,依然有部分碱基序列固定在电极表面上,这部分碱基序列会与连接探针Link1和Link2、杂交探针H3和H4进行自组装,形成一条dsDNA链;最后,六氨合钌通过静电作用吸附在dsDNA骨架上,通过检测六氨合钌的电化学信号,实现对microRNA的超灵敏检测。 2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,具体包括以下步骤: (1)针对目标microRNA设计双功能探针H1,所述探针为发夹结构的DNA探针;设计固定在电极表面的探针H2,该发夹探针5'端修饰巯基; (2)双特异性核酸内切酶(DSN酶)特异性切割:将6μL含有不同浓度microRNA的DSN缓冲液加入装有4μL 5μM的双功能探针H1溶液的微量离心管中反应120min;使双特异性核酸内切酶特异性切割DNA-RNA杂交的DNA部分,得到8-17DNAzyme序列,并释放microRNA继续与其余未反应的H1探针杂交循环切割,实现目标循环放大;其中DSN缓冲液包含:0.2U DSN,50mM Tris-HCl,10mM MgCl2,1 mM DTT,pH 8.0; (3)电极预处理:将直径为2mm的金电极在新配制的食人鱼溶液浸泡,然后依次用0.3μm和0.05 μm的Al2O3粉末在抛光绒布打磨,然后用超纯水冲洗干净,分别在乙醇和超纯水中超声清洗5min,然后将电极置于0.5M的H2SO4溶液中,在-0.35-1.6V电位下扫描,直到在0.95V出现一个尖锐的还原峰,在0.12-0.14V范围内出现三个小的、连续的氧化峰,用超纯水冲洗电极,氮气吹干,备用;食人鱼溶液为98%硫酸和30%双氧水按3:1的体积混合; (4)捕获探针H2的固定:在9μL含有500mM NaCl、1mM EDTA、10mM TCEP、pH 8.0的10mMTris-HCl缓冲液中加入1μL 10μM捕获探针H2溶液,得到捕获探针H2固定液;将捕获探针H2固定液滴加到金电极表面,室温孵育120min,H2可通过S-Au键固定在电极表面,再用10mMpH 8.0的Tris-HCl缓冲液冲洗电极表面,氮气吹干; (5)电极表面空白位点封闭:将10μL 2μM的疏基己醇溶液滴加到步骤(4)所得电极表面,室温孵育120min,封闭电极表面的非特异性活性位点,用10mM pH 8.0的Tris-HCl缓冲液冲洗电极表面,氮气吹干; (6)8-17DNAzyme的切割循环:将步骤(2)微量离心管中的溶液滴加于步骤(5)处理好的电极表面,孵育90min,用10mM pH 8.0的Tris-HCl缓冲液冲洗,氮气吹干; (7)DNA自组装电化学生物传感器的构建:将步骤(6)得到的电极用10mM pH 8.0的Tris-HCl缓冲液冲洗吹干后,依次在电极表面滴加10μL含有1μM连接探针Link1缓冲液,10μL 1μM的连接探针Link2缓冲液,10μL含有0.5μM H3和0.5μM H4的杂交探针缓冲液,分别反应90min、90min和120min,超纯水冲洗,氮气吹干; (8)电化学检测microRNA信号:将含有10μM六氨合钌的电化学检测液通氮气,再将步骤(7)所得电极置于电化学检测液中,电化学工作站在-0.6-0V电势范围内用方波伏安法扫描检测。 3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述探针H1序列为:CACCCACTACCCATCTTTACCAGACAGTGTTACATCTCTTCTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGGGTG; 所述探针H2为:SHCH2CH2CH2CH2CH2CH2TTTTTCCACCACATTCAAATTCACCAACTATrAGGAAGAGATGTTACGAGGCGGTGGTGG; 所述Link1序列为:CCA ACTAAC CCCATATAGTTGGTGAAT; 所述Link2序列为:ATGGGGTTAGTT GGATCGCCT CATACTGTCTCAAGG ACCACCGCAT; 所述H3序列为:TCTCAAGGACCACCGCAT CTCTAC ATGCGGTGGTCCTTGAGA CAGTATGAG GCGA; 所述H4序列为:GTAGAG ATGCGGTGGTCCTTGAGA TCGCCT CATACTG TCTCAAGGACCACCGCAT。 4.如权利要求1或2所述方法制备获得电化学生物传感器。 5.如权利要求4所述电化学生物传感器用于microRNA的检测。 |
所属类别: |
发明专利 |