专利名称: |
一种应用于细胞体的多色荧光蛋白浓度的检测方法及设备 |
摘要: |
本申请适用于生物技术领域,提供了一种应用于细胞体的多色荧光蛋白浓度的检测方法及设备,包括:获取检测所需的启动子的个数,并为每个启动子配置关联的荧光蛋白;将各个启动子以及关联的荧光蛋白进行组装,生成N色荧光蛋白组件;将N色荧光蛋白组件封装于目标载体,并将目标载体导入至待检测对象;采集待检测对象体内关于N色荧光蛋白组件的光强参量;根据各个荧光蛋白的光强与浓度之间的斜率参量以及光强参量,分别计算各个荧光蛋白的浓度值。本申请通过斜率参量对光强参量进行分离,计算得到关于各个荧光蛋白的浓度值,即便不同荧光蛋白的光谱存在重叠的情况,也能够一一进行分离,最终用荧光蛋白浓度而非荧光强度表征启动子的活性,提高了启动子以及基因活性检测的准确性。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
广东;44 |
申请人: |
中国科学院深圳先进技术研究院 |
发明人: |
金帆;杨帅;夏爱国 |
专利状态: |
有效 |
申请日期: |
2019-08-29T00:00:00+0800 |
发布日期: |
2019-11-15T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN201910808830.X |
公开号: |
CN110455765A |
代理机构: |
深圳中一联合知识产权代理有限公司 |
代理人: |
褚淑杰 |
分类号: |
G01N21/64(2006.01);G;G01;G01N;G01N21 |
申请人地址: |
518000广东省深圳市南山区深圳大学城学苑大道1068号 |
主权项: |
1.一种应用于细胞体的多色荧光蛋白浓度的检测方法,其特征在于,包括: 获取检测所需的启动子的个数,并为每个所述启动子配置关联的荧光蛋白; 将各个所述启动子以及关联的所述荧光蛋白进行组装,生成N色荧光蛋白组件;所述N的值为所述启动子的个数; 将所述N色荧光蛋白组件封装于目标载体,并将所述目标载体导入至待检测对象; 采集所述待检测对象体内关于所述N色荧光蛋白组件的光强参量; 根据各个所述荧光蛋白的光强与浓度之间的斜率参量以及所述光强参量,分别计算各个所述荧光蛋白的浓度值。 2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述根据各个所述荧光蛋白的光强与浓度之间的斜率参量以及所述光强参量,分别计算各个所述荧光蛋白的浓度值,包括: 从所述光强参量中提取各个所述荧光蛋白对应荧光光谱的荧光光强;所述荧光光强具体为N个所述荧光蛋白在所述荧光光谱下的光强之和; 根据各个所述荧光蛋白在所述荧光光谱对应的所述斜率参量,构建关于各个所述荧光光谱的光强方程; 根据N个所述光强方程,计算出各个所述荧光蛋白的所述浓度值。 3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述采集所述待检测对象体内关于所述N色荧光蛋白组件的光强参量,包括: 获取用于采集所述N色荧光蛋白组件的荧光光谱的激励光强以及照射时长; 根据所述激励光强以及所述照射时长对所述N色荧光蛋白组件的原始光强进行归一化处理,得到第一中间参量; 获取与采集所述N色荧光蛋白组件的荧光光谱的光路匹配的调整参数以及摄像装置的设备参数,通过所述调整参数与所述设备参数调整所述第一中间参量,得到第二中间参量; 根据所述待检测对象的细胞高度对所述第二中间参量进行调整,得到所述光强参量。 4.根据权利要求1-3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述获取检测所需的启动子的个数,并为每个所述启动子配置关联的荧光蛋白,包括: 识别各个所述启动子预配置的第一前缀序列以及第一后缀序列; 从所述荧光蛋白库中选取第二前缀序列与所述第一后缀序列匹配的荧光蛋白作为所述启动子的荧光蛋白。 5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述将各个所述启动子以及关联的所述荧光蛋白进行组装,生成N色荧光蛋白组件;所述N的值为所述启动子的个数,包括: 将所述启动子与该启动子关联的所述荧光蛋白进行组装,得到单色荧光蛋白组件;所述单色荧光蛋白组件的前缀序列为所述启动子的第一前缀序列,所述单色荧光蛋白组件的后缀序列为关联的所述荧光蛋白第二后缀序列; 若任一其他单色荧光蛋白组件的第二后缀序列与所述单色荧光蛋白组件的第一前缀序列匹配,则识别该其他单色荧光蛋白组件为所述单色荧光蛋白组件的上联蛋白组件; 若任一其他单色荧光蛋白组件的第一前缀序列与所述单色荧光蛋白组件的第二后缀序列匹配,则识别该其他单色荧光蛋白组件为所述单色荧光蛋白组件的下联蛋白组件; 基于所述上联蛋白组件以及所述下联蛋白组件,依次对各个所述单色荧光蛋白组件进行组装,得到所述N色荧光蛋白组件。 6.根据权利要求1-3任一项所述的检测方法,其特征在于,在所述将所述N色荧光蛋白组件封装于目标载体,并将所述目标载体导入至待检测对象之前,还包括: 识别所述待检测对象的对象类型; 获取与所述对象类型匹配的目标载体。 7.根据权利要求1-3任一项所述的检测方法,其特征在于,所述获取检测所需的启动子的个数,并为每个所述启动子配置关联的荧光蛋白,包括: 解析所述用户发送的测试任务; 基于所述测试任务确定所述启动子的个数。 8.一种应用于细胞体的多色荧光蛋白浓度的检测设备,其特征在于,包括: 荧光蛋白识别单元,用于获取检测所需的启动子的个数,并为每个所述启动子配置关联的荧光蛋白; 荧光蛋白组件生成单元,用于将各个所述启动子以及关联的所述荧光蛋白进行组装,生成N色荧光蛋白组件;所述N的值为所述启动子的个数; 目标载体封装单元,用于将所述N色荧光蛋白组件封装于目标载体,并将所述目标载体导入至待检测对象; 光强参量采集单元,用于采集所述待检测对象体内关于所述N色荧光蛋白组件的光强参量; 浓度值计算单元,用于根据各个所述荧光蛋白的光强与浓度之间的斜率参量以及所述光强参量,分别计算各个所述荧光蛋白的浓度值。 9.一种终端设备,其特征在于,所述终端设备包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时如权利要求1至7任一项所述方法的步骤。 10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述方法的步骤。 |
所属类别: |
发明专利 |