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一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用
| 专利名称： | 一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用 |
| 摘要： | 本发明涉及一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用，通过MALDI‑TOF MS对VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的质谱蛋白特征峰进行分析，建立区分两种亚型的识别模型；通过该识别模型可快速准确地鉴别VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌，具有操作简便，耗时短等优点，因此，这为MALDI‑TOF MS鉴定细菌亚型的研究提供了全新的思路，具备非常广的应用前景。 |
| 专利类型： | 发明专利 |
| 国家地区组织代码： | 重庆;50 |
| 申请人： | 中国人民解放军陆军特色医学中心 |
| 发明人： | 李进;鲁卫平;胡韦维;黎敏;黄庆;邓少丽 |
| 专利状态： | 有效 |
| 申请日期： | 2019-08-24T00:00:00+0800 |
| 发布日期： | 2019-11-26T00:00:00+0800 |
| 申请号： | CN201910786373.9 |
| 公开号： | CN110501414A |
| 代理机构： | 重庆知创恒源知识产权代理事务所(普通合伙) |
| 代理人： | 廖曦 |
| 分类号： | G01N27/62(2006.01);G;G01;G01N;G01N27 |
| 申请人地址： | 400042 重庆市渝中区大坪长江支路10号 |
| 主权项： | 1.一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型的构建方法，其特征在于，具体步骤如下： (1)首先将VIM型和SPM型菌株质谱结果导入SARAMIS数据库，通过对两者质谱峰进行聚类分析，发现两者之间存在部分有差异的质谱峰；然后通过LaunchPad软件将两者质谱峰进行比较分析，得到17个高信号强度峰作为两者的共有质量峰； (2)为筛选VIM型和SPM型菌株之间有差异的特征峰，再次利用LaunchPad软件分别比较VIM型菌株和非VIM型以及SPM型菌株和非SPM型的质谱特征峰； (3)最后选取VIM型菌株的4个特征峰和非VIM型菌株的3个特征峰作为鉴定VIM型的模型，选取SPM型菌株的2个特征峰和非SPM型菌株的2个特征峰作为鉴定SPM型的模型。 2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，步骤(1)中，随机选择15株VIM型和15株SPM型菌株通过SARAMIS软件对两种菌株质量相同的峰数量进行聚类分析。 3.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，步骤(1)中，所述的17个高信号强度峰包含：3601m/z,4434m/z,4544m/z,4849m/z,4992m/z,5114m/z,5210m/z,5737m/z,6046m/z,6348m/z,6676m/z,7203m/z,7595m/z,8786m/z,9089m/z,9987m/z和10229m/z。 4.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，步骤(3)中，VIM型菌株的4个特征峰为：3230m/z,3409m/z,5450m/z,7329m/z，非VIM型菌株的3个特征峰为3429m/z,5490m/z,7390m/z。 5.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，步骤(3)中，SPM型菌株的2个特征峰为3663m/z,6264m/z，非SPM型菌株的2个特征峰为4068m/z,4282m/z。 6.利用权利要求1～5中任一项所述方法构建的一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型。 7.权利要求6所述识别模型在VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌鉴别中的应用。 8.一种快速、准确鉴别VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的方法，是利用权利要求6所述识别模型，通过VITEK MS SARAMIS软件对菌株的质谱特征峰进行分析，从而对VIM型和SPM型进行区分。 |
| 所属类别： | 发明专利 |
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