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原文传递患有实体癌症的患者的分类方法

专利名称：	患有实体癌症的患者的分类方法
摘要：	本发明涉及患有实体癌症的患者的分类方法，特别是涉及用于对患有实体癌症的患者的存活时间进行预后的方法和/或用于评估患有实体癌症的患者对抗肿瘤治疗的响应性的方法。所述方法是基于对多种免疫应答标志物进行定量以及确定当与参比分布比较时与值对应的分布的百分位数。计算不同标志物的所确定的百分位数的平均值或中值并且将该值与所述平均或中值百分位数的参比值进行比较，其结果与存活期或响应性有关。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	法国;FR
申请人：	法国国家卫生及研究医学协会
发明人：	热罗姆·加隆;贝恩哈德·米雷克尼克;弗兰克·帕格斯
专利状态：	有效
申请日期：	2017-05-09T00:00:00+0800
发布日期：	2019-04-26T00:00:00+0800
申请号：	CN201780028301.7
公开号：	CN109690314A
代理机构：	中原信达知识产权代理有限责任公司
代理人：	金海霞;杨青
分类号：	G01N33/574(2006.01);G;G01;G01N;G01N33
申请人地址：	法国巴黎
主权项：	1.一种用于对患有实体癌症的患者的存活时间进行预后的体外方法，所述方法包括以下步骤： a)对指示所述患者针对所述癌症的免疫应答的状态的两种或更多种生物标志物进行定量，其中在从所述患者获得的肿瘤样品中对指示所述免疫应答的状态的每一种生物标志物进行定量； b)将在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值与从患有所述癌症的患者的参比组对于所述两种或更多种生物标志物中的每一种所获得的值的分布进行比较； c)对于在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值确定与在步骤a)中获得的值相对应的分布的百分位数； d)计算所述百分位数的算术平均值或中值；以及 e)将在步骤d)中获得的所述百分位数的算术平均值或中值与百分位数的预定的参比算术平均值或预定的中值进行比较，预定的参比值与存活时间有关。 2.一种用于评估患有实体癌症的患者对抗肿瘤治疗的响应性的体外方法，所述方法包括以下步骤： a)对指示所述患者针对所述癌症的免疫应答的状态的两种或更多种生物标志物进行定量，其中在从所述患者获得的肿瘤样品中对指示所述免疫应答的状态的每一种生物标志物进行定量； b)将在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值与从患有所述癌症的患者的参比组对于所述两种或更多种生物标志物中的每一种所获得的值的分布进行比较； c)对于在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值确定与在步骤a)中获得的值相对应的分布的百分位数； d)计算所述百分位数的算术平均值或中值；以及 e)将在步骤d)中获得的所述百分位数的算术平均值或中值与百分位数的预定的参比算术平均值或预定的中值进行比较，预定的参比值与对所述抗肿瘤治疗的响应有关。 3.权利要求1或2的方法，其中所述实体癌症是结肠直肠癌、乳腺癌、肺癌、头颈部癌、膀胱癌、卵巢癌或前列腺癌。 4.权利要求3的方法，其中所述实体癌症是结肠直肠癌。 5.权利要求1至4任一项的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括来自免疫系统的细胞的细胞密度。 6.权利要求5的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括CD3+细胞的密度、CD8+细胞的密度、CD45RO+细胞的密度、GZM-B+细胞的密度、B细胞的密度和/或DC细胞的密度。 7.权利要求6的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括CD3+细胞的密度和CD8+细胞的密度；CD3+细胞的密度和CD45RO+细胞的密度；CD3+细胞的密度和GZM-B+细胞的密度；CD8+细胞的密度和CD45RO+细胞的密度；CD8+细胞的密度和GZM-B+细胞的密度；或CD45RO+细胞的密度和GZM-B+细胞的密度。 8.权利要求5至7任一项的方法，其中在所述肿瘤的中心处和/或在所述肿瘤的侵袭性边缘中对所述来自免疫系统的细胞的密度进行定量。 9.权利要求8的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括所述肿瘤的中心处CD3+细胞的密度、所述肿瘤的中心处CD8+细胞的密度、所述侵袭性边缘中CD3+细胞的密度和所述侵袭性边缘中CD8+细胞的密度。 10.权利要求5至9任一项的方法，其中在所述肿瘤样品中所述密度最低的区域中测量所述密度。 11.权利要求5至9任一项的方法，其中在所述肿瘤样品中所述密度最高的区域中测量所述密度。 12.权利要求1至11任一项的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括以下一种或多种基因的表达水平：CCR2、CD3D、CD3E、CD3G、CD8A、CXCL10、CXCL11、GZMA、GZMB、GZMK、GZMM、IL15、IRF1、PRF1、STAT1、CD69、ICOS、CXCR3、STAT4、CCL2和TBX21。 13.权利要求1至12任一项的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括以下一种或多种基因的表达水平：GZMH、IFNG、CXCL13、GNLY、LAG3、ITGAE、CCL5、CXCL9、PF4、IL17A、TSLP、REN、IHH、PROM1和VEGFA。 14.权利要求1至12任一项的方法，其中所述两种或更多种生物标志物包括代表人类适应性免疫应答的至少一种基因的表达水平和代表人类免疫抑制应答的至少一种基因的表达水平。 15.权利要求14的方法，其中所述代表人类适应性免疫应答的至少一种基因选自：并且所述代表人类免疫抑制应答的至少一种基因选自： CD274 CTLA4 IHH IL17A PDCD1 PF4 PROM1 REN TIM-3 TSLP VEGF 。
所属类别：	发明专利