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原文传递 一种基于建模-预测策略的靶标脂质组学方法
专利名称: 一种基于建模-预测策略的靶标脂质组学方法
摘要: 本发明属于医药技术领域,具体涉及一种靶标脂质组学方法,更确切地说是一种应用“建模‑预测”的策略对血浆中溶血磷脂胆碱(LPC)进行高效灵敏地定性定量分析。本发明以碳链长度(x1)和双键个数(x2)为自变量,去簇电压(DP),碰撞能(CE),保留时间(RT),响应因子(RF)为因变量建立多元线性回归模型,总结LPC(13:0),LPC(14:0),LPC(15:0),LPC(17:0)LPC(18:1)LPC(19:0)LPC(20:0)对照品的液相质谱参数规律,然后用该方程预测无法获得对照品的LPC的相应参数。使用预测出来的液相质谱参数对血浆中的LPC进行定量分析,并通过独立样本T检验、PLS‑DA、单因素ROC曲线筛选不同癌症的生物标志物,通过多因素ROC曲线评价其诊断能力。
专利类型: 发明专利
国家地区组织代码: 辽宁;21
申请人: 沈阳药科大学
发明人: 李清;毕开顺;刘然;许华容;张倩;于鑫淼;韩涛
专利状态: 有效
申请日期: 2019-01-21T00:00:00+0800
发布日期: 2019-05-07T00:00:00+0800
申请号: CN201910053337.1
公开号: CN109725046A
代理机构: 沈阳杰克知识产权代理有限公司
代理人: 靳玲
分类号: G01N27/62(2006.01);G;G01;G01N;G01N27
申请人地址: 110016 辽宁省沈阳市沈河区文化路103号
主权项: 1.一种基于“建模-预测”策略的靶标脂质组学方法,其特征在于,包括如下步骤: (1)“建模-预测”策略: 首先以碳链长度(x1)和双键个数(x2)为自变量,去簇电压(DP),碰撞能(CE),保留时间(RT),响应因子(RF)为因变量建立多元线性回归模型,总结LPC(13:0),LPC(14:0),LPC(15:0),LPC(17:0)LPC(18:1)LPC(19:0)LPC(20:0)对照品的液相质谱参数规律,然后用该方程预测无法获得对照品的LPC的相应参数; (2)血浆样品预处理; (3)液相分离; (4)MS测定; (5)数据处理:首先通过独立样本T检验、PLS-DA、单因素和多因素ROC曲线筛选不同癌症的生物标志物。 2.如权利要求1所述的方法,其特征在于, 步骤(2)中取血浆样品,加入甲醇、内标溶液,涡旋,超声离心,取上清液进行LC-MS分析;其中,所述的内标溶液是LPC(13:0),所述的血浆与甲醇的体积比为:1:3-1:5。 3.如权利要求1所述的方法,其特征在于, 步骤(3)中液相分离的条件是: 色谱柱:Kinetex XB-C18(4.6×100mm,2.6μm); 流动相:A相:0.1-0.3%甲酸水,B相:0.1-0.3%甲酸甲醇; 流速:0.4ml·min-1; 进样量:2μl; 柱温:25℃; 梯度洗脱程序见表1。 表1梯度洗脱程序 4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述癌症为肺癌、乳腺癌、结直肠癌或胃癌。 5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,肺癌的生物标志物为LPC18:1(sn-1),LPC18:2(sn-1),LPC18:2(sn-2),LPC19:2(sn-2)。 6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,乳腺癌的生物标志物为LPC 18:2(sn-1),LPC18:2(sn-2),LPC 22:4(sn-1)。 7.如权利要求4所述的方法,其特征在于,结直肠癌的生物标志物为LPC 17:0(sn-1),LPC 19:0(sn-2),LPC 19:1(sn-2),LPC 19:2(sn-2)。 8.如权利要求4所述的方法,其特征在于,胃癌的生物标志物为LPC 18:0(sn-1),LPC19:0(sn-2),LPC 20:0(sn-1),LPC 20:0(sn-2)。 9.权利要求1所述的方法在测定溶血磷脂胆碱的浓度中的应用。 10.权利要求1所述的方法在筛选癌症生物标记物中的应用。
所属类别: 发明专利
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