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原文传递一种鉴定金黄色葡萄球菌是否耐药的方法

专利名称：	一种鉴定金黄色葡萄球菌是否耐药的方法
摘要：	本发明公开了一种鉴定金黄色葡萄球菌是否耐药的方法。该方法包括：采用MALDI‑TOF/TOF质谱仪对待测金黄色葡萄球菌进行检测，获得MALDI指纹图谱；采用mascot搜索引擎将MALDI指纹图谱与SEQ ID No.1进行比对，如果MALDI指纹图谱与SEQ ID No.1不匹配，则所述待测金黄色葡萄球菌为或候选为耐药菌株；如果MALDI指纹图谱与SEQ ID No.1匹配，则所述待测金黄色葡萄球菌不为或候选不为耐药菌株。该方法操作简便，可快速准确地鉴别耐药菌和敏感菌，整个流程不超过10分钟，具有耗时短、灵敏度高、特异性高的优点，可为临床治疗由该类细菌引起的严重感染争取宝贵的时间。
专利类型：	发明专利
国家地区组织代码：	北京;11
申请人：	中国中医科学院医学实验中心
发明人：	李贤煜;王毅;李连达;杨伟峰;姜童童
专利状态：	有效
申请日期：	2017-12-20T00:00:00+0800
发布日期：	2019-06-28T00:00:00+0800
申请号：	CN201711385350.4
公开号：	CN109946367A
代理机构：	北京纪凯知识产权代理有限公司
代理人：	关畅;张立娜
分类号：	G01N27/62(2006.01);G;G01;G01N;G01N27
申请人地址：	100700 北京市东城区东直门内南小街16号
主权项：	1.一种鉴定待测金黄色葡萄球菌是否耐药的方法，包括如下步骤： (a)采用MALDI-TOF/TOF质谱仪对待测金黄色葡萄球菌进行检测，获得MALDI指纹图谱； (b)采用mascot搜索引擎，将步骤(a)获得的所述MALDI指纹图谱与79AA特征序列进行比对，所述79AA特征序列如SEQ ID No.1所示，根据比对结果按照如下确定所述待测金黄色葡萄球菌是否耐药：如果所述MALDI指纹图谱与所述79AA特征序列不匹配，则所述待测金黄色葡萄球菌为或候选为耐药菌株；如果所述MALDI指纹图谱与所述79AA特征序列匹配，则所述待测金黄色葡萄球菌不为或候选不为耐药菌株。 2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(a)中，采用所述MALDI-TOF/TOF质谱仪对所述待测金黄色葡萄球菌进行检测前还包括如下步骤：将所述待测金黄色葡萄球菌接种到固体培养基上培养成单菌落；挑取单菌落涂布于所述MALDI-TOF/TOF质谱仪的靶盘圆点处，涂布厚度大于0mm且小于1mm；然后覆盖基质。 3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：所述基质为α-氰基-4-羟基肉桂酸。 4.根据权利要求2或3所述的方法，其特征在于：采用所述MALDI-TOF/TOF质谱仪对所述待测金黄色葡萄球菌进行检测时设置参数如下：Shots为500，激光能量85％，谱图采集范围200～20000m/z。 5.一种鉴定待测金黄色葡萄球菌是否耐药的方法，包括如下步骤：鉴定所述待测金黄色葡萄球菌的蛋白质组中是否含有SEQ ID No.1所示的氨基酸序列，如果所述待测金黄色葡萄球菌的蛋白质组中不含有SEQ ID No.1所示的氨基酸序列，则所述待测金黄色葡萄球菌为或候选为耐药菌株；如果所述待测金黄色葡萄球菌的蛋白质组中含有SEQ ID No.1所示的氨基酸序列，则所述待测金黄色葡萄球菌不为或候选不为耐药菌株。 6.多肽，其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。 7.权利要求6所述多肽在作为标记用于鉴定待测金黄色葡萄球菌是否耐药中的应用。 8.一种将待测金黄色葡萄球菌菌群按照耐药与否进行分组的方法，包括如下步骤： (A)采用MALDI-TOF/TOF质谱仪对待测金黄色葡萄球菌菌群中的所有个体进行检测，获得各自的MALDI指纹图谱； (B)将步骤(A)获得的所有待测金黄色葡萄球菌的所述MALDI指纹图谱分别与Biotyper3.0软件中的数据库进行比对，确定种属并获得匹配分值； (C)将步骤(A)获得的所有待测金黄色葡萄球菌的所述匹配分值基于PearsonCorrelation做分值的分层聚类统计分析，从而将所述待测金黄色葡萄球菌菌群按照耐药与否分为两组。 9.根据权利要求1-5和7-8中任一所述的方法或应用，其特征在于：所述耐药为耐甲氧西林。
所属类别：	发明专利