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原文传递 基于血清的布鲁氏菌感染快速检测方法
专利名称: 基于血清的布鲁氏菌感染快速检测方法
摘要: 本发明提供了基于血清的布鲁氏菌感染快速检测方法,涉及蛋白质谱检测技术领域。本发明根据布鲁氏菌感染血清和健康人血清的质谱数据,通过ClinProTools软件的SVM模型算法构建感染布鲁氏菌血清的标准检测模型,并获得了用于鉴别布鲁氏菌感染血清的特征蛋白组合,所构建模型的识别能力为99.15%,交叉验证值为96.04%。利用标准检测模型对待测血清的MALDI‑TOF MS质谱数据进行分类分析,可准确判断待检测血清是否为布鲁氏菌感染。本发明方法适于布鲁氏菌感染人群的血清检测,准确度高、重复性好,通量高,检测成本低廉,结果可靠,具有良好的应用前景。
专利类型: 发明专利
申请人: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
发明人: 肖迪;姜海;张慧芳;张炳华;王磊;杨文涛;李天一;赵飞
专利状态: 有效
申请日期: 1900-01-20T09:00:00+0805
发布日期: 1900-01-20T14:00:00+0805
申请号: CN202010156263.7
公开号: CN111007139A
代理机构: 北京路浩知识产权代理有限公司
代理人: 陈征
分类号: G01N27/62;G16B5/00;G16B50/00;G;G01;G16;G01N;G16B;G01N27;G16B5;G16B50;G01N27/62;G16B5/00;G16B50/00
申请人地址: 102206 北京市昌平区昌百路155号
主权项: 1.一种检测感染布鲁氏菌(Brucella)血清的特征蛋白组合,其特征在于,所述特征蛋白组合中每个特征蛋白的质荷比m/z分别为:2069.35、2081.28、2932.93、3095.84、4466.26、6631.4、7644.8、8930.09、9514.58、9578.16。 2.权利要求1所述的特征蛋白组合在构建检测布鲁氏菌(Brucella)感染血清的试剂盒或检测模型中的应用。 3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,利用ClinProTools软件的SVM模型算法进行构建。 4.一种检测感染布鲁氏菌(Brucella)血清的标准检测模型,其特征在于,通过以下方法构建得到: (1)将具有统计学意义数量的布鲁氏菌抗体阴性的人血清样本、布鲁氏菌感染抗体阳性的人血清样本经富集蛋白处理后,采集血清样本的MALDI-TOF MS质谱数据形成两组数据; (2)利用ClinProTools软件,按软件使用要求编辑参数,将步骤(1)中获得的两组质谱数据调入,进行峰统计分析; (3)选择模型算法,构建得到标准检测模型,并确定10个特征蛋白,每个特征蛋白的质荷比m/z分别为:2069.35、2081.28、2932.93、3095.84、4466.26、6631.4、7644.8、8930.09、9514.58、9578.16。 5.根据权利要求4所述的标准检测模型,其特征在于,所述模型算法为SVM模型,算法参数选择:模型中峰数目设为在1-25范围内自动选择,最邻近分类数选择1-7进行优化。 6.权利要求4或5所述的标准检测模型在构建布鲁氏菌感染血清检测系统中的应用。 7.一种布鲁氏菌感染的血清检测系统,其特征在于,所述检测系统的工作程序包括以下步骤: (1)前处理待检测血清样本,以富集血清中的蛋白; (2)前处理后的血清样本点到质谱仪样本靶上,自然干燥后在样本上覆盖基质饱和溶液; (3)采用质谱仪采集数据,每个样本平行采集两张原始谱图数据; (4)采用ClinProTools软件调用权利要求4或5所述标准检测模型,对步骤(3)获得的全部待测血清样本的原始数据进行检索分类,确定检测的血清样本是来源于健康人还是布鲁氏菌感染者。 8.根据权利要求7所述的血清检测系统,其特征在于,步骤(3)中,采集的数据强度叠加至少为1.0×104。 9.根据权利要求7或8所述的血清检测系统,其特征在于,所述质谱仪为MALDI-TOF 质谱仪,氮激光器波长377nm, 质量采集范围1000至20000Da,源1电压, 20 kV, 源2电压,18.5 kV, 透镜电压, 8.45 kV;延时提取, 320 ns; 激光频率20Hz,调整总采集频次使谱图总强度大于10000;采用大肠杆菌ATCC8739质控校正仪器,使质量偏差小于300ppm。
所属类别: 发明专利
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