原文传递
基于蛋白-蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法
| 专利名称： | 基于蛋白-蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法 |
| 摘要： | 本发明涉及一种基因技术领域的基于蛋白-蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法，所述方法包括如下步骤：从“数据集B”中找出和“集合A”发生直接相互作用的基因/蛋白，并命名为“节点集B”；统计“节点集B”中每个基因/蛋白和“集合A”发生直接相互作用的数目，命名为维度“i”；用具有不同最小维度“i”的“节点集B[i]”从“集合A”中调出那些相互作用的基因/蛋白，并被命名为“集合A[i]”；计算“集合A[i]”的聚集z值；具有最大聚集z值的“集合A[i]”为所得基因集。本发明的方法能够鉴定出和生物过程更加相关的基因集，有助于相关研究人员开展相关研究工作。 |
| 专利类型： | 发明专利 |
| 申请人： | 上海市公共卫生临床中心 |
| 发明人： | 吴康;黄家颖;范小勇 |
| 专利状态： | 有效 |
| 申请日期： | 2014-07-30T00:00:00+0800 |
| 发布日期： | 2019-01-01T00:00:00+0800 |
| 申请号： | CN201410370730.0 |
| 公开号： | CN104182654A |
| 代理机构： | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 |
| 代理人： | 牛山;陈少凌 |
| 分类号： | G06F19/18(2011.01)I |
| 申请人地址： | 201508 上海市金山区漕廊公路2901号 |
| 主权项： | 一种基于蛋白?蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤一，从“数据集B”中找出和“集合A”发生直接相互作用的基因/蛋白，并命名为“节点集B”；“节点集B”中的基因/蛋白来自于“数据集B”，且和“集合A”没有共有基因/蛋白；步骤二，统计“节点集B”中每个基因/蛋白和“集合A”发生直接相互作用的数目，该数目被命名为“节点集B”中基因/蛋白的维度“i”，“节点集B”中的基因/蛋白具有不同的维度；步骤三，用具有不同最小维度“i”的“节点集B[i]”从“集合A”中调出那些相互作用的基因/蛋白，并被命名为“集合A[i]”，“集合A”中剩余的基因/蛋白被命名为“集合A[i]余”；步骤四，计算“集合A[i]”的聚集z值；步骤五，具有最大聚集z值的“集合A[i]”为所鉴定的基于蛋白?蛋白相互作用网络的基因集。 |
| 所属类别： | 发明专利 |
检索历史
应用推荐
