专利名称: |
一种基于拟多级谱进行完整糖基化肽段的质谱检测方法 |
摘要: |
本发明涉及一种基于拟多级谱进行完整糖基化肽段的质谱检测方法,及其在肝癌的早期诊断中的应用。该发明主要包括以下五个步骤:1)糖基化肽段的富集;2)去糖基化肽段‑完整糖基化肽段的样品制备;3)去糖基化肽段‑完整糖基化肽段的质谱检测;4)去糖基化肽段‑完整糖基化肽段的谱图数据检索;5)在此基础上,结合糖基化位点、完整糖肽定量技术,实现肿瘤患者与正常人的糖基化精细差异分析,筛选潜在的疾病标记物。本方法实现了人源蛋白质糖基化的精细解析,在肿瘤标志物的筛选方面具有重要的应用潜力。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
辽宁;21 |
申请人: |
中国科学院大连化学物理研究所 |
发明人: |
叶明亮;秦洪强;陈尧;王璐 |
专利状态: |
有效 |
申请日期: |
2017-12-14T00:00:00+0800 |
发布日期: |
2019-07-02T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN201711339389.2 |
公开号: |
CN109959699A |
代理机构: |
沈阳科苑专利商标代理有限公司 |
代理人: |
马驰 |
分类号: |
G01N27/62(2006.01);G;G01;G01N;G01N27 |
申请人地址: |
116023 辽宁省大连市中山路457号 |
主权项: |
1.一种基于拟多级谱进行完整糖基化肽段的质谱检测方法,其特征在于: (1)去糖基化肽段-完整糖基化肽段的样品制备,利用亲水作用色谱富集蛋白样品酶解物中的糖基化肽段,将富集的糖基化肽段分作两份,取其中一份采用糖苷酶进行糖基化肽段的糖链简化处理,并将糖苷酶处理的去糖基化肽段与糖基化肽段混合,进行二者的同时检测; (2)去糖基化肽段-完整糖基化肽段的同时质谱检测,主要是利用质谱的不同碎裂能量(包含并不局限于台阶能量碎裂模式),实现去糖基化肽段-完整糖基化肽段的同时高效碎裂; (3)去糖基化肽段-完整糖基化肽段的谱图数据检索,利用完整糖肽碎裂产生的特征碎裂,进行糖链结构的确认,并结合相应的去糖基化肽段,确认完整糖肽的肽段骨架序列信息和糖链结构。 2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(1)中, 1)取人源细胞或组织样品,进行蛋白质样品的提取和酶解,以及糖基化肽段富集; 2)步骤1)结束后得到的样品,按比例分成两份,其中一份使用糖苷酶进行去糖基化处理,并将两份样品重新混合,待进行后续样品富集。 3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中, 1)将步骤(1)收集的去糖基化肽段-完整糖基化肽段混合样品复溶,同时在一次液相色谱进行分离,有效降低二者保留时间的差异; 2)在步骤1)实现了去糖基化肽段-完整糖基化肽段同时分离的基础上,利用不同的质谱碎裂模式(包含并不局限于台阶能量碎裂模式),进行二者的同时碎裂,获得相应的碎裂谱图库。 4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(3)中, 1)将步骤(2)采集的质谱经过收集其中的糖碎片鎓离子(204.0875Da等),确认相应的完整糖肽碎裂谱图,并进行收集,根据N-糖的五核心结构确定其中的肽段骨架序列分子量,并获得相应糖链的分子量; 2)将步骤1)剩余的谱图进行去糖基化肽段的直接检索,获得相应肽段的序列骨架信息; 3)将步骤1)与2)获得的糖链信息、完整糖肽的肽段分子量与去糖基化肽段进行匹配,并利用保留时间、精确分子量等特征进行控制假阳性率,获得完整糖基化肽段的结构信息。 5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:该方法能同时获取相应的糖基化蛋白质、糖基化肽段和糖基化位点的鉴定结果,可以用于糖基化修饰的蛋白质组学分析。 6.根据权利要求1、2、3或4所述的方法,其特征在于:利用权利要求1、2、3或4所述的方法,分别对肿瘤患者和正常人的血清、组织样品进行分析,结合糖基化位点占有率差异、完整糖基化肽段的定量差异,实现肿瘤患者与正常人的糖基化精细差异分析,可筛选潜在的疾病标记物。 7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:进行肿瘤患者和正常人收集血清、组织中N-连接位点占有率、位点特异性糖肽的分析,实现其糖基化精细结构差异分析,获得相应的差异糖基化肽段,用于提高临床诊断准确度和预后的效果评价,可在肝癌、肺癌等恶性肿瘤的早期诊断中的应用。 |
所属类别: |
发明专利 |