专利名称: |
一种新的糖蛋白完整O-糖肽定量分析方法 |
摘要: |
本发明提供了一种糖蛋白完整O‑糖肽定量分析方法,包括以下步骤:(1)糖蛋白加热变性后,进行还原烷基化处理,打开糖蛋白的二硫键并烷基化封闭;(2)N‑糖链去除:在超滤管中使用PNGase F蛋白酶切除糖肽上的N‑糖链,离心去除N‑糖链;(3)获得肽段:在超滤管中使用胰蛋白酶将蛋白质酶切成肽段,离心即得肽段;(4)亲水作用色谱纯化:HILIC填料结合肽段,洗涤除杂,再洗脱得O‑糖肽;(5)使用LC‑MS/MS分析完整O‑糖肽;(6)使用Xcalibur定性定量分析完整O‑糖肽。本发明能简单、有效地实现糖肽相对定量,具有良好的应用前景。 |
专利类型: |
发明专利 |
国家地区组织代码: |
四川;51 |
申请人: |
四川大学华西医院 |
发明人: |
张勇;杨浩;程惊秋 |
专利状态: |
有效 |
申请日期: |
2019-01-10T00:00:00+0800 |
发布日期: |
2019-04-26T00:00:00+0800 |
申请号: |
CN201910025651.9 |
公开号: |
CN109682911A |
代理机构: |
成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) |
代理人: |
李高峡;张娟 |
分类号: |
G01N30/88(2006.01);G;G01;G01N;G01N30 |
申请人地址: |
610000 四川省成都市武侯区国学巷37号 |
主权项: |
1.一种糖蛋白完整O-糖肽定量分析前处理方法,其特征在于,包括以下步骤: (1)糖蛋白加热变性后,进行还原烷基化处理,打开糖蛋白的二硫键并烷基化封闭; (2)N-糖链去除:在超滤管中使用PNGase F蛋白酶切除糖肽上的N-糖链,离心去除N-糖链; (3)获得肽段:在超滤管中使用胰蛋白酶将蛋白质酶切成肽段,离心即得肽段; (4)亲水作用色谱纯化:HILIC填料结合肽段,洗涤除杂,再洗脱得O-糖肽。 2.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(1)所述还原烷基化处理是使用终浓度15-25mmol/L的二硫苏糖醇在50-60℃振荡反应0.5-1h,加入终浓度40-60mmol/L碘乙酰胺在室温避光反应0.5-2h;优选地,步骤(1)所述二硫苏糖醇的终浓度是20mmol/L,碘乙酰胺的终浓度是50mmol/L。 3.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(2)所述酶切反应遵照如下参数: 酶用量:每20μg糖蛋白使用1U的酶; 反应温度:37℃; 反应时间:2h。 4.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(2)和/或步骤(3)所述超滤管的过滤孔径是30KD。 5.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(1)、(2)和/或(3)的反应环境中还有含有30-70mmol/L的碳酸氢铵;优选地,含有50mmol/L的碳酸氢铵。 6.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(4)所述HILIC填料是博纳爱杰尔的Venusil HILIC填料。 7.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(4)所述结合是在室温旋转结合2h。 8.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(4)所述洗涤除杂所用流动相为水、乙腈、三氟乙酸的混合液,体积比按前述顺序为:(10~30)∶(70~90)∶0.2;优选地,体积比按前述顺序为20∶80∶0.2。 9.如权利要求1所述的前处理方法,其特征在于,步骤(4)所述的洗脱时用0.1%(v)三氟乙酸溶液洗脱。 10.一种糖蛋白完整O-糖肽定量分析方法,其特征在于,它包括权利要求1-7任一所述的前处理方法,它还包括: a.使用LC-MS/MS分析完整O糖肽; b.使用Xcalibur软件定量分析完整O糖肽。 11.如权利要求10所述的分析方法,其特征在于,步骤a所述的LC-MS/MS的色谱条件为: 色谱柱:Magic C18柱; 流动相A液:0.1%(v)三氟乙酸的水溶液; 流动相B液:0.1%(v)三氟乙酸的乙腈溶液; 流动相B的线性梯度:6~32%; 流动相的流速:0.6μL/min。 12.如权利要求10所述的分析方法,其特征在于,步骤a所述的LC-MS/MS中使用的质谱仪碎裂模式为EThcD,时间为78min,流速为0.6μL/min。一级质谱离子扫描的质量范围为800~2000Da,分辨率为6000,AGC为1e6,最大IT为50ms;二级质谱TopN设置为20,AGC为5e4,最大IT为150ms,循环时间为3s。 13.如权利要求10所述的分析方法,其特征在于,步骤b的分析步骤包含: a.手工累计MS1谱图,生成去卷积后的质谱图; b.将电荷状态归一到单电荷,去除单同位素峰以外的其它同位素峰,得到肽段信号; c.生成信号列表,根据Y1值,计算肽段质量; d.用上述单同位素峰质量减去肽段质量,即为候选的糖型;去卷积后的峰强度对应前述糖型的丰度。 |
所属类别: |
发明专利 |